HRM(High Resolution Melt),即高分辨溶解曲线,是近几年来在国际上兴起的最新的SNP及突变研究工具。其商品化的仪器为LightScanner96/384,LightScanner32。LightScanner高分辨溶解曲线分析系统是美国Idaho公司生产的专门用于快速基因突变扫描和基因分型的高通量检测系统。这种方法因其操作简便、快速,使用成本低,结果准确,并且实现了真正的闭管操作而受到普遍的关注。
LightScanner高分辨溶解曲线分析系统
LightScanner高分辨溶解曲线分析系统由美国Idaho公司生产,是世界上第一台利用HRM技术对96或384孔板PCR产物进行基因突变扫描和基因分型的HRM仪器。
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主要特点:
- 5分钟即可得到96/384孔板的PCR产物检测结果,20000个SNP/天
- 准确、特异性好
- 检测费用低,1RMB/PCR产物
- 操作简单
- PCR产物直接检测,无需进行任何处理
- 节省了99%的测序工作量
- 分析时不消耗PCR产物,分析结束后PCR产物可直接用于下游的分析
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LightScanner 32实时荧光定量PCR & 高分辨溶解曲线分析系统(HRM)
由美国Idaho公司制造的LightScanner 32(LS32™)是同时具有高分辨率溶解曲线(HRM)和定量PCR双重功能的分析系统,是目前世界上最快速的实时定量PCR仪器。
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- 支持多种检测模式:染料法和SimpleProbes、FRET probes、HybProbe等多种标记探针
- 三通道实时荧光检测,分别是530nm、640nm、705nm
- 20min以内完成一次检测
- 30秒内完成一个PCR循环
- 终身免维护LED激发光源
- 32位样品卡盘,一次分析32个样品
- 使用20ul玻璃毛细管,表面/容积比高,导热快速精准
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仪器主要应用方面:
1、基因突变扫描和基因分型(Genotyping)
2、等位基因频率分析
3、物种鉴定、品种鉴定
4、甲基化研究
5、法医学鉴定、亲子鉴定
6、动植物遗传育种,微生物研究
应用一:基因突变扫描(Mutation Discovery)
未知SNP扫描,LightScanner直接检测PCR产物可以发现序列中是否有未知的SNP
实验设计:
图一:设计引物,扩增目的片段(一般为100~400bp大小),在PCR之前掺入LC Green荧光染料(图一左),针对扩增的目的片段进行HRM分析,可找出新的未知SNP(图一右)。
应用二:基因分型(Genotyping)
方法一:Small Amplicon(小片段法)进行已知SNP位点基因分型

图二:针对已知SNP位点设计小片段(一般片段大小50~100bp),PCR前掺入LC Green荧光染料,对PCR产物进行HRM检测,采用Small Amplicon分析,可以给出该SNP位点的3种基因型。
方法二:Luna Probe(非标记探针)法进行已知SNP位点基因分型
图三:针对已知SNP位点设计20~35bp Luna Probe(非标记探针,与普通引物价格相当),PCR前掺入LC Green荧光染料,针对PCR产物进行HRM检测,采用Luna Probe分析,可以给出该SNP位点的3种基因型。
高分辨溶解曲线用LC Green plus荧光染料
由美国Idaho公司独家生产的专门用于高分辨率溶解曲线分析的LC Green plus荧光染料,为美国Idaho公司的专利产品,在中国由思博全科技(香港)有限公司独家代理。
- 专门用于高分辨溶解曲线分析(HRM)
- 针对单碱基的SNP检测和基因分型
- 荧光信号强,光学稳定性好,可长期保存
- 可在PCR之前过量加入,对PCR无抑制作用
思博全科技有限公司致力于为生命科学领域科研人员提供代表世界领先科技水平的实验设备和方法,以解决用户的实际问题、得出高水平的科学实验数据和提供完善的技术支持及售后服务为己任,与科研实验室人员建立密切联系和沟通,训练有素的精英团队以百分的热情为用户提供实验方案设计、引物优化、探针设计、数据分析等全方位的技术支持。 |