

SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit
单细胞测序近年来也是比较热门的研究方向,各种技术不断推出,百花齐放。如何从中取舍,清清楚楚明明白白真真切切的得到想要的结果呢?升级后的看点有哪些,让小编为您一一揭秘。
适用的细胞类型进一步拓宽:可用于癌症研究,如循环肿瘤细胞(CTC),激光捕获显微切割(LCM)细胞或DNA,以及细针抽吸(FNA)细胞等;也可用于生殖健康研究,如胚胎细胞和循环胎儿细胞;以及用于发育生物学研究,如胚胎细胞,干细胞和稀有细胞;还可以用于宏基因组学和微生物学研究,如微生物细胞,微生物组和环境样品。
适用的检测范围进一步完善:不仅保持了拷贝数变异(CNV)和染色体异倍性的高水平检测,同时实现单核苷酸变异(SNV)、Indel和其他SV的高准确度检测,并且大幅提升了扩增的覆盖度和均一性。在SNV和CNV检测方面优于MDA技术!
PicoPLEX Gold 与A 产品(MDA法)覆盖度、均一性和再现性的比较

| (数据均来源于Takara Bio Inc.) |

Panel A. 以单细胞(1c),5个细胞(5c)或15 pg的 NA12878 gDNA起始,比较A产品(MDA),PicoPLEX Gold(PP Gold)和SMARTer PicoPLEX WGA(PP WGA)这3个试剂盒之间的SNV检测率。其中1个和5个细胞的测序深度为35M read pairs, gDNA样品深度为40M read pairs。与A产品(灰色)和PicoPLEX WGA(紫色)相比,PicoPLEX Gold(蓝色)有高的保真度和覆盖度,可以高质量的检测更多的SNV(2-9倍),具有明显的优势。
Panel B. PicoPLEX Gold(蓝色)的B等位基因频率的对称分布,以0.5为中心,展示两个等位基因的平衡情况。与A产品(MDA)相比,PicoPLEX具有更好的等位基因平衡(灰色)。
Panel C. PicoPLEX Gold的无偏扩增, 在测试的所有单细胞文库制备技术中,表现出最低的等位基因脱扣率(假阴性)。
Panel D. PicoPLEX Gold试剂盒中的聚合酶具有高保真度(蓝色),使得等位基因插入率与A产品(灰色)相当,且显著低于PicoPLEX WGA(紫色)。
| (数据均来源于Takara Bio Inc.) |
期望PicoPLEX Gold作为一剂良方,帮您看清单细胞全基因组测序的纷扰!
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