10x Genomics全新产品Visium HD火热预定进行!

Visium HD能够将全转录组空间基因表达的能力与单细胞分辨率相结合,发现组织中微米级的独特生物学见解。通过易于运行、基于CytAssist的工作流程,获得一流的数据质量。

借助Visium HD,成为空间探索新时代的先行者之一。基于无偏全转录组空间分析的可靠价值,Visium HD使您能够以革命性的分辨率和数据质量揭示FFPE组织样本中微米级的独特生物学特性:

  • 单细胞分辨率:新一代玻片的结构是在2 x 2 µm的带条形码标签的方格中提供转录本数据,以单细胞分辨率对组织进行生物学分析
  • 连续的组织覆盖:通过连续排列有寡核苷酸的捕获区域(并且条形码方阵之间没有间隙!),探索整张组织切片中以往被隐藏的生物学信息。
  • 高质量的空间数据:CytAssist平台能够实现精准的转录本定位,让您胸有成竹地绘制最小生物结构和最复杂细胞微环境的空间结构图谱
以您所需的分辨率提供空间发现能力

在单细胞分辨率上进行全转录组基因表达分析,并具有连续的组织覆盖率。

获得组织中微米级的高质量数据

利用Visium CytAssist实现行业领先的转录本定位,来生成超高质量的空间转录组数据。

实现各种FFPE样本的空间分析

Visium HD与含有mRNA的人类和小鼠福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织切片兼容。这包括存档的FFPE蜡块和载玻片上的预先切片的组织。我们计划未来将样本扩展到其他组织条件。

将组织学提升到一个新的水平

Visium HD空间基因表达与用于形态学分析的苏木精和伊红 (H&E) 染色以及用于蛋白质共检测的免疫荧光 (IF) 染色兼容。可利用来自同一组织切片的高分辨率空间转录组学数据来提升对H&E和IF成像样本的分析。

Visium HD玻片:新一代的玻片结构,实现单细胞分辨率

Visium HD空间基因表达玻片包含两个6.5 x 6.5 mm捕获区域,其中寡核苷酸连续排列在数百万个无间隙的2 x 2 µm条形码标记的正方形中,实现单细胞级的空间分辨率。数据以2 µm正方形单位以及多个合并的分析单位输出。8 x 8 µm大小的分析单位是推荐的可视化和分析的起始点。

Visium CytAssist:通过简单的工作流程获得无与伦比的空间数据质量
  • 遵循标准的组织学操作流程,直接在载玻片上对组织进行切片、染色和成像
  • 预筛选以找到最具生物学意义的组织切片
  • 无需优化即可探索各种各样的FFPE组织

数据分析:易于使用的可视化工具将组织学和基因表达数据无缝结合

10x Genomics提供两种类型的软件来帮助您分析数据:Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger是一款分析软件,可自动将空间基因表达信息叠加在组织图像上,并识别具有相似转录特征的条形码标记的方块簇。然后,您可以使用Loupe Browser(一种可视化软件)以交互方式探索结果。您可以从10x Genomics支持网站免费下载Space Ranger和Loupe Browser。

探索组织背景中的基因表达簇

将数千个基因的表达映射到显微镜成像的H&E或IF图像上

识别邻近区域的基因特征