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Small RNA CLEAR-CLIP-seq：精准鉴定small RNA 靶点的研究利器
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—— Small RNA CLEAR-CLIP-seq 技术重磅发布！
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small RNA（包括 miRNA、tRF&tiRNA、sdRNA 等）是重要的小型非编码RNA分子，通过序列互补配对引导AGO蛋白结合mRNA的3'-UTR或CDS区域，从而介导mRNA降解或翻译抑制。
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small RNA 靶点研究的核心难题
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small RNA 在发育、代谢、肿瘤、免疫等多种生命过程中发挥关键调控作用，但small RNA‑靶点互作的精准鉴定长期面临挑战，传统生信预测方法依赖 small RNA 种子区（2-8 nt）与靶点互补配对的序列识别，往往产生大量假阳性结果，且难以识别非常规结合模式。因此亟需一种能够直接、无偏捕获 small RNA‑靶标互作的新技术。
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CLEAR-CLIP-seq：精准解析 small RNA-靶点互作的突破性技术！
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Aksomics 全新推出 CLEAR-CLIP-seq （共价连接-交联免疫沉淀测序）平台，通过紫外交联富集捕获与内源mRNA靶标共价连接的small RNA，并通过高通量测序鉴定检测small RNA-靶标嵌合体，从而直接获得small RNA及其靶标的结合序列信息。
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图1. small RNA 通过引导AGO蛋白结合
mRNA导致mRNA降解或翻译抑制；
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CLEAR-CLIP-seq 能够无偏识别 small RNA 在体内的真实结合位点，覆盖 miRNA、tRF&tiRNA、sdRNA 等多类型 small RNA，以及 mRNA、lncRNA 等多类型靶标 RNA，构建全面的 small RNA 调控网络。
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CLEAR-CLIP-seq 技术优势
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检测范围广泛：覆盖 miRNA、tsRNA、sdRNA 等多类型 small RNA，并可解析其与mRNA、lncRNA 等多层次靶标互作网络；
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突破传统预测局限：不仅解析 3'-UTR 结合，还能识别 CDS 区域及非常规结合模式；
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直接捕获 small RNA-靶标嵌合体：实现一对一明确配对，显著降低假阳性率；
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结合多组学分析：支持联合 RNA-seq、Ribo-seq，筛选具有功能意义的关键靶点。
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