样本制备

Xenium工作流程从在Xenium载玻片上制备组织切片开始（图1）。对切片进行处理，在保留和暴露RNA后用可环化的DNA探针对其进行标记。DNA探针的两端带有两个可与RNA靶点独立杂交的区域，并包含一段基因特异性的条形码序列。随后探针末端的相互连接产生了一个可酶促扩增的环状DNA探针。如果探针的某个部分出现脱靶结合，则不会发生连接，从而抑制脱靶信号并确保高特异性。

多重蛋白检测是未来将在该平台上实现的一种成熟功能，它将采用带有DNA条形码的抗体来标记每张组织切片中的蛋白靶点。

Xenium工作流程也是非破坏性的。在流程结束时，样本形态完好无损，可在同一张组织切片上进行苏木精—伊红（H&E）染色和免疫荧光（IF）染色，便于直接比较Xenium转录数据与形态学数据。

图1. Xenium原位基因表达分析的工作流程概览