GEM-X Epi Multiome

GEM-X Epi Multiome(原名为Chromium Single Cell ATAC + Gene Expression)能够从同一细胞核中同时获得染色质可及性和基因表达的双重读数,揭示表观遗传调控如何影响细胞身份和功能。本文将为您介绍这一实验方法的优势、Epi Multiome检测方案的基本工作原理、GEM-X技术带来的实验和成本效率提升,以及如何快速上手。

表观遗传调控——它就像是控制DNA这套“硬件”的“软件”;这套程序决定着哪些特定基因被表达、哪些被沉默,并会根据环境信号、细胞间相互作用或细胞内信号,不断重写自己的指令(图1)。

它可以表现为阻断转录机器的DNA甲基化位点,也可以是让DNA紧密缠绕、阻止特定区域被转录的组蛋白。这些表观遗传特征等因素,共同构成了一部动态的“规则手册”,控制着基因表达,进而决定每个细胞的状态和功能。


图1. 如果DNA是硬件,表观遗传就是软件。

如果您心中对细胞身份也有类似的疑问——为什么您研究系统中的某种细胞状态会表现出这样的行为——那么,一个能够呈现表观遗传调控的视角,或许正是填补这一空白的关键。

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为什么需要同一细胞的多组学分析
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您希望更深入地了解自己的细胞和样本。凭直觉,您就能理解多组学分析的价值——同时呈现多个生物学层面的信息。但您同样希望获得尽可能可靠的信息,以便基于准确的数据构建假设和结论。这正是为什么直接关联的多组学读数,比通过推断建立的关联更具优势。

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如何从同一细胞核中同时检测染色质可及性和基因表达?
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为了帮助您快速上手,我们将拆解GEM-X Epi Multiome工作流程的基本步骤(图2),并为您介绍一些能够助您取得成功的实用工具。


图2. GEM-X Epi Multiome工作流程。

《GEM-X Epi Multiome 基金申请资源》

一款包含检测试剂和配套软件、并提供全面技术支持的一体化解决方案。
作为业界首款可在数十万个单细胞中同时捕获同一单细胞内转录组学和表观基因组学多模态信息的商业化解决方案 的最新演进版本,该技术能够从珍贵样本中最大限度地获取数据,并实现scRNA-seq与scATAC-seq数据的直接关联,从而避免 了关联独立数据集所带来的计算误差。此外,通过统一呈现细胞的开放染色质图谱与基因表达谱,研究人员得以解析细胞类型和 状态的建立过程,发现新的基因调控相互作用,并结合关键表达标志物解读表观遗传学图谱。

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