Twist 的 RNA 测序工作流程提供完整的 NGS 解决方案,可生成用于 RNA 测序的均一文库。Twist 提供靶向和全转录组工作流程,可缩短手动操作时间,并与我们当前的 NGS 试剂组(包括靶向富集试剂盒)集成。每个工作流程都可生成高质量的文库,可用于针对起始量和类型各异的样本(包括转化研究样本)进行测序。

Twist 定制 RNA 组合的设计合成可覆盖各种组合大小和转录靶标区域,且能保持卓越一致的性能。Twist 借鉴深厚的设计经验,开发了外显子感知设计算法来靶向单个外显子,同时不会优先选择任何一个外显子-外显子连接位点。我们已将这种设计方法应用于 Twist RNA 外显子组,使其成为转录组分析和融合检测的良好工具。

 

端到端的工作流程通过结合简化且高效的文库制备试剂盒、高质量的唯一双标签 (UDI)、唯一分子标识符、优化的靶向富集和专有的外显子感知组合设计算法,实现了这一点。

靶向 RNA 测序

  • 创建定制组合以仅对重要的 RNA 转录本进行测序
  • 结合 Twist RNA 文库制备、Twist 杂交和 RNA 靶向富集组合
  • 即使对于来自 FFPE 样本的低质量、降解的 RNA,也能增强关键靶标的检测灵敏度

RNA 外显子组和靶向测序序

  • 蛋白质编码区和独特剪接位点的外显子感知探针设计
  • 每个样本的读取次数更少,能够检测更多的样本
  • 靶向 19708 个基因和 63215 种亚型
  • 整个转录组富集超过 1.8 倍
了解更多信息

全转录组测序

  • 测量 mRNA、lncRNA 和其他 RNA 种类的表达水平
  • 利用从新鲜和 FFPE 样本中提取的总 RNA 制备文库
  • 将 Twist RNA 文库制备与 Twist rRNA & Globin 去除试剂盒结合使用
  • 在 5 小时内完成 RNA 文库制备
了解更多信息

RNA 融合检测

  • 使用 Twist Alliance CeGaT 融合组合富集已知和新型融合
  • 与 CeGaT 合作设计专业内容
  • 使用 Twist RNA 文库制备试剂盒优化完整的工作流程,以生成测序就绪文库
  • 利用 Twist 核心捕获富集技术,大幅提高效率
了解更多信息
 

Twist 的 RNA 产品提供完整的 NGS 解决方案,可为 RNA 测序生成均一的测序文库。端到端的工作流程通过结合简化且高效的文库制备试剂盒、高质量的唯一双标签 (UDI)、唯一分子标识符、优化的靶向富集和专有的外显子感知组合设计算法,实现了这一点。

 

Twist 靶向 RNA 测序工作流程

  • 创建定制组合,以仅对重要的 RNA 转录本进行测序
  • 结合 Twist RNA 文库制备、Twist 杂交和 RNA 靶向富集组合
  • 即使对于来自 FFPE 样本的低质量、降解的 RNA,也能增强关键靶标的检测灵敏度

 

Twist 全转录组测序工作流程

  • 测量 mRNA、lncRNA 和其他 RNA 种类的表达水平
  • 利用从新鲜和 FFPE 样本中提取的总 RNA 制备文库
  • 将 Twist RNA 文库制备与 Twist rRNA & Globin 去除试剂盒结合使用
  • 在 5 小时内完成 RNA 文库制备

 

RNA 外显子组

 

专为人类转录组设计

靶向 35.8 Mb 碱基、19,708 个基因和 63,215 种亚型
使用来自 Gencode 和 RefSeq 的序列构建
全转录组富集超过 1.8 倍

 

专为 RNA 构建的靶向富集

蛋白质编码区、融合和亚型的外显子感知探针设计
每个样本的读取次数更少,能够检测更多的样本
与 FFPE 和低 RNA 起始量样本兼容

更多靶标,更少读数

Twist RNA 外显子组在不同起始量的 FFPE 和通用人类参考 RNA 中以更少的读数检测更多靶标。所有文库均使用 Twist RNA 文库制备试剂盒制备。

 

RNA 融合

基因融合通常在多种癌症类型中充当致癌驱动突变。快速准确地检测这些融合可以为临床行动提供信息并推动治疗决策。Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合试剂盒是一种基于 RNA 的富集组合,与传统方法相比,它提供了优化灵敏的靶向方法来研究基因融合。

该组合包括与大约 30 种癌症类型相关的 160 个融合基因。融合基因由欧洲的领先基因诊断和测序公司 CeGaT 选定。该设计不仅用于检测已知的基因融合,还用于识别新的基因融合。

该组合通过优化和验证,可与 Twist RNA 文库制备试剂盒配合使用,以实现完整的端到端工作流程的卓越性能。基于 RNA 的富集方法具有高捕获效率,可提高检测的灵敏度。该组合非常适合用于筛选肿瘤学样本,为确定治疗方案提供信息或发现用于肿瘤分类的新型融合*。

 

可靠地富集 RNA 基因融合

与 CeGaT 合作设计专业内容
使用 Twist RNA 文库制备试剂盒优化的工作流程
Twist 核心富集技术大幅提高捕获效率

 

客户评价

“在 CeGaT,我们希望为我们的客户提供全面且平价的肿瘤诊断。Twist 靶向富集技术是一个强大的工作流程,使我们能够在高通量实验室工作流程中准确分析具有 80 多种治疗可操作性融合变异的患者样本。我们可以避免与基于扩增子的工作流程相关的等位基因丢失问题。基于我们自己的验证,该组合使我们能够报告临床上可操作的结果并为治疗决策提供支持。”**
 
Florian Battke 博士,CeGaT GmbH 开发部主管
 
**免责声明:结果特定于获得该结果的机构,可能无法反映在其他机构可实现的结果。

组合设计

• 在断点设计中与 66 个基因相关的 160 个融合基因

• 7394 个探针

• 涵盖多种不同的癌症类型

*注:Twist Alliance CeGaT RNA 融合组合 – 3 MB 已通过 ISO-13485 认证。

免费下载 Twist RNA 测序工作流程解决方案


更多详情,请访问:
www.twistbioscience.com


更多详情,敬请关注