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R-Loops:癌症和疾病领域的活跃参与者
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Molecular Cancer |异常R-loop形成对癌症进展的影响
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R-Loop 研究意义
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R-Loops是指出现在基因组DNA中的RNA: DNA三链杂合环结构。它们是在基因组中编码和非编码区域的新生RNA转录过程中形成的。R-Loops具有重要的生物学功能,在临床上与癌症、神经和心血管疾病有重要联系。
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R-loop测序技术服务
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研究RNA通过形成R-LOOP调控基因表达,以发现和探索它们在研究中的功能、机制和临床应用。我司技术优势:
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链特异性:在参考基因组中识别 R-loop 中的lncRNA/mRNA 的精确位置和所在DNA链的方向。
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R-loop溯源:根据R-loop富集区域和具体位置预估形成R-loop的来源lncRNA/mRNA。
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质控严格:设置阴性对照组和阳参,以控制文库质量。
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稳定性高:实验操作稳定性高,减少实验操作带来的误差。
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结果全面:具备丰富的注释信息,提供数据可视化文件,绘有文章发表级别的图谱。
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客户的高分文章
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图1:R-Loop评分与LUAD进展的相关性以及异常R-loop形成对癌症进展的影响
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为探索R-loop与肺腺癌(LUAD)进展的关系,作者采用 R-loop测序技术,并敲低R-loop关键调节因子FANCI,发现FANCI敲低明显影响R-loop在基因区域(图1A)以及各种基因元件上的分布(图1B),而且R-loop差异富集基因在癌症发展相关信号通路上有显著富集(图1C),敲低FANCI对Ras信号通路的活性也有显著削弱,导致下游的PI3K/AKT/NF-κB和MAPK/ERK通路被进一步抑制,最终抑制肿瘤细胞的增殖、迁移能力,促进肿瘤细胞凋亡(图1D)。此外,文章还利用单细胞测序与R-loop调节因子的表达数据构建了R-loop评分模型,发现R-loop评分在不同状态和分期病人中具有显著差异(图1E)、与恶性肿瘤细胞的免疫逃逸基因表达显著相关(图1F),且LAUD患者的生存率与R-loop评分也显著关联(图1G)。这些结果共同说明,R-loop可作为LUAD预后预测和临床治疗的潜力因子。
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文章解析:Molecular Cancer (37.3): 异常R-loop通过介导免疫逃逸、细胞通讯和代谢重编程影响癌症进展的分子机制(R-loop测序服务由康成|数谱生物提供)
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