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研究开发出用于酵母基因功能分析的强大的工具包
【字体: 大 中 小 】 时间:2004年11月08日 来源:生物通
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生物通报道:已经知道60%的酵母基因在人类基因组中至少有一个对应物。最近,研究人员在酵母基因研究方面又有新进展。由Hopkins的研究人员开发的一种工具包从6000个酵母菌株(每个菌株都丢失一种不同的基因)的集合入手,能够使研究人员确定出哪些基因被敲除后能导致酵母菌株的死亡。这项进展在2004年11月5日的Molecular Cell上有详细叙述。
人类细胞中,除了卵细胞和精子外,一般每个基因都有两个拷贝,但是酵母细胞中每个基因却有两个或者一个拷贝。在6000个酵母突变体集合中,每个基因只有一个拷贝。因此丢失了的基因没有“备份”剩下,从而导致生长缓慢。
已经有许多实验室利用这种“单敲除”酵母集合进行实验。而Xuewen Pan博士则发现了一种保护这个集合遗传完整性的方法,因此能够提升实验的可重复性。Pan博士通过给所有基因添加第二个拷贝来避免收集到遗传杂质。然后,他会在适当的时候清除掉多余出的那套基因。这种工具包的第二个优势是所有酵母突变株被混在一起并且能够被同时研究。
研究人员将这个技术联合体命名为dSLAM(diploid-based synthetic lethality analysis on microarrays)。DSLAM比之前的方法更易操作,因此适用范围将会更广。为了测试这种新方法,Pan等人用它来分析已经用其它方法分析过的“synthetic lethality”实验。测试结果表明这种新方法精确性较高并且与其它测试方法得出的结果相一致。