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新数据库促进艾滋病药物开发
【字体: 大 中 小 】 时间:2004年07月20日 来源:
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生物通报道:对于那些从事治疗爱滋病的药物开发或者是研究HIV病毒的研究者来说现在又有一个新资源可以利用,这就是美国标准与技术研究院(National Institute of Standards and Technology,NIST)刚刚对公共开放的一个艾滋病相关蛋白结构数据库。
在与美国国家癌症研究所的协作下,HIV结构参考数据库(http://xpdb.nist.gov/hivsdb/hivsdb.html)将会接受、注释、存档以及发布各种参与HIV病毒形成的蛋白的结构数据,以及抑制这种活性的一些分子的数据。此前大部分的这类信息由于尚未公布而不容易获得。新的数据库中的数据有的来源于出版的文献报道,还有部分由企业实验室或其它的一些实验室的直接提供。
新数据库对于寻求抑制HIV蛋白酶的方法很有用,HIV蛋白酶在HIV的成熟过程中非常关键。同时,新数据库有助于科学家们了解和克服HIV突变造成的抗药性问题。
NIST的科学家们对源于各种资源的蛋白结构数据信息进行注释、分类以及编入索引以方便用户能较准确的找到自己所需要的。他们为HIV蛋白酶抑制剂索引开创了一项新技术,使科学家们能快速而准确的得到所有有关酶-抑制剂复合物的数据信息,例如能抗某一种特殊药物的变异株。
NIST在生产、评估以及发布化学数据信息方面已有很长的历史,如今又将这一专长逐步运用到生物科学领域。HIV数据库是一个正在开发和测试中的、用于注释和标准化HIV抑制剂名称以及评估大分子的结构数据的模型。 (Alex)