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第一个搜索遗传多样性的网络服务器诞生
【字体: 大 中 小 】 时间:2004年07月21日 来源:
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生物通报道:Universitat Autonoma de Barcelona的研究人员开发了第一台容许用户大规模分析遗传多样性的网络服务器。这个网络服务将为遗传性疾病的遗传基础研究提供便利。相关文章发表在Nucleic Acids Research on Bioinformatics特别版上。服务器的名称为PDA(Pipeline Diversity Analysis)。全世界的生物学研究者将第一次能够利用储存在巨大的、公开的基因组数据库(如Genbank)中的资料来寻找不同个体和物种间的微小的差别。
这些变异是了解地球上的生物多样化以及同种个体间的差异的关键。以我们自己为例,这些差异决定了一个人是蓝眼睛还是棕色眼睛、浅色或深色皮肤以及患某种类型癌症的风险高低。这就是遗传变异能为遗传性疾病研究提供非常有价值的信息的原因,并且它已经成为基因组学研究中一个重要的科研领域。
这项由Sonia Casillas和Antonio Barbadilla创立的网络服务由一套能自动在大型的公开的DNA数据库中搜索遗传序列的程序构成,能够将这些序列分类并在不同的区域测定遗传多样性,从而寻找核苷酸多态性SNP——同一物种不同个体间DNA分子上的“字母”的微小变化。
创造出能自动搜索和分析资料的生物信息学工具是现在生物医药学研究处理大量分子信息的一个需要优先考虑的问题。而PDA服务器则为科研机构的研究提供便利,其网址为http://pda.uab.es (Yang Shujuan)