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基因表达分析为何不跳过RNA纯化?[新品推荐]
【字体: 大 中 小 】 时间:2014年09月03日 来源:生物通
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随着高通量基因表达分析的广泛应用,如全基因组RNAi和化合物库的筛选,人们期待简洁的方法,不需要收集细胞和RNA纯化,就能直接对96孔细胞培养物进行基因表达分析。为此,Bio-Rad公司近日推出了新的细胞快速裂解试剂盒,让研究人员能直接从培养的细胞中获得RT-qPCR数据,而不需要单独的RNA纯化。
对于基因表达分析而言,逆转录再加定量PCR(RT-qPCR)是十分经典的方法。标准流程无需多说,大家都清楚。然而,对于细胞培养物的基因表达分析,我们还需要收集细胞,并分离RNA,这是个漫长而繁琐的过程。尽管技术已成熟,但仍是分析中的限速步骤。
随着高通量基因表达分析的广泛应用,如全基因组RNAi和化合物库的筛选,人们期待简洁的方法,不需要收集细胞和RNA纯化,就能直接对96孔细胞培养物进行基因表达分析。为此,Bio-Rad公司近日推出了新的细胞快速裂解试剂盒,让研究人员能直接从培养的细胞中获得RT-qPCR数据,而不需要单独的RNA纯化。
SingleShot™ 便是这一系列试剂盒的名称。它包括细胞裂解液、蛋白酶K和DNase溶液,能够在20分钟内产生细胞培养物的裂解液。这些裂解液经过优化,适用于一步法或两步法定量PCR。
SingleShot™ 细胞裂解试剂盒能够处理下至10个细胞,上至100,000个细胞的样品,在完整去除基因组DNA的同时保留RNA的完整性,避免了柱纯化所带来的转录本损失,让基因表达结果有着出色的重复性和准确性。此外,与其他类似产品不同,Bio-Rad的试剂盒不需要额外的移液步骤来终止细胞裂解反应,这也有利于分析自动化。
正如Bio-Rad的高级产品经理Paul Streng所说,SingleShot试剂盒非常适合那些工作量大的高通量实验室,以及那些细胞数量有限,而又需要准确分析的研究人员。
SingleShot试剂盒中还包含了RNA对照,让研究人员能确定最佳细胞数和RT-qPCR反应的起始量。而市场上其他一些类似的产品大多不含RNA对照。这些试剂盒经过验证,适合常用的人类和鼠类细胞系,如各种类型的贴壁和悬浮细胞。
SingleShot系列产品不仅包括单独的细胞裂解试剂盒,还包括一步法和两步法的RT-qPCR试剂盒,分别与SYBR Green法和探针法兼容。所有SingleShot试剂盒都与经过验证的PrimePCR引物兼容。
Bio-Rad同时也发布了SingleShot SYBR Green Kit的技术指南,对其性能进行评估,并与其他产品进行比较。有兴趣的读者可以看看。(生物通 余亮)
技术指南: