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miRNAscope ISH 原位杂交:以单细胞分辨率检测ASO、miRNA、siRNA的空间和形态学背景

【字体: 时间:2020年12月15日 来源:Bio-Techne

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  miRNAscope 检测是一种先进的高度特异且灵敏的原位杂交检测,凭借 RNAscope 核心技术,能以单细胞分辨率观察完整组织或培养细胞中的小分子 RNA 表达。

科研领域技术的进步提升了我们对生命科学的认识,同时也对技术本身提出了更高的要求。过去的技术例如测序,得到的往往是“群体细胞的平均结果”,但是随着对细胞群体中细胞异质性的认识深入,引发了对单细胞分辨率、以及对时空分辨率的要求。

虽然芯片、PCR技术均可提供有用的疾病分子图谱,但在分析过程中丢失了临床相关的重要细胞和组织背景信息,以及基因表达模式的空间变化。RNAscope™ 技术是一种先进的原位杂交检测技术,能够以单细胞分辨率直接观察完整组织中的单分子基因表达。这种检测体现了 RNA 原位杂交方法的重大进步,其专利的探针设计能够扩增靶点特异性的信号,而不会通过非特异性杂交扩增背景噪音。miRNAscope 检测是一种先进的高度特异且灵敏的原位杂交检测,凭借 RNAscope 核心技术,能以单细胞分辨率观察完整组织或培养细胞中的小分子 RNA 表达。

miRNAscope 检测特别适合这些小分子检测:

• 反义寡核苷酸(ASO)       
• 小干扰 RNA(siRNA)
• microRNA(miRNA)       
• 长度在17-50 nt的小 RNA 序列

miRNAscope 检测的优势

•高度特异且灵敏的小分子 RNA 检测
•具有空间背景,达到亚细胞分辨率,在组织背景下更深度评估靶点
•高信噪比的小 RNA 靶点成像,结果容易解释
•通用的检测条件适用于所有靶点
•快速的探针设计,可靶定任何物种中几乎所有的小分子标志物(17-50 nt)
•与 IHC 兼容,可实现小 RNA 和蛋白质共检测
•简单快速的工作流程,适用于自动和手动检测平台

应用

•检测和鉴定细胞亚型
•在形态学背景下观察基因调控
•验证完整组织中的 miRNA 生物标志物
•了解小分子 RNA 疗法的导入机制
•评估生物分布和治疗效果
•为异质性的组织生物学和分析增添视觉维度

应用案例

在精准医疗领域中,利用反义寡核苷酸(ASO)和小干扰 RNA(siRNA)作为治疗平台,为各种疾病带来了潜在的解决方案。以高的灵敏度和特异性观察完整组织中寡核苷酸药物的能力对于评估治疗安全性和有效性至关重要。miRNAscope™ 检测是高度特异且灵敏的原位杂交检测能够:

•评估治疗性 ASO 和 siRNA 的导入策略、生物分布、细胞摄取和持久性
•在空间和形态学背景下,以单细胞分辨率观察完整组织或培养细胞中小分子 RNA 的表达
•通过高通量且快速的流程评估以 RNA 为靶点的治疗效果
•筛选可能的脱靶效应

ASO
ASO 作为治疗方案,可通过改变特定蛋白质的合成来调控疾病进程。

上图显示了经过处理的小鼠四头肌组织样本中检测到 ASO 靶点(黄色箭头),而载体样本中未检测到,表明 ASO 疗法的成功导入。

siRNA
siRNA 可通过沉默特定的基因靶点而成为潜在的治疗剂。

上图显示了仅在 siRNA#1 处理的小鼠肝组织样本中特异性检测到 siRNA#1 探针(黄色箭头),而在生理盐水处理的阴性样本或 siRNA#2 处理的样本中未检测到,表明 siRNA 疗法的成功导入以及 miRNAscope 检测的特异性。在 siRNA#1 处理的样本中也观察到 siRNA 靶点的生物分布。

注:上面的组织玻片经过苏木精复染,提供蓝色的细胞染色。

用户评价

“我们在化合物筛选工作中有一段使用 miRNAscope 的绝佳体验。这种技术的特异性极佳,结果也很容易理解。同时,与 ACD 团队的合作也让人受益匪浅。他们在整个过程中与我们沟通,确保我们的问题有了答案。他们还完成了无解可击的组织染色!”

——美国纽约一家领先的生物制药公司

“我们与 ACD BIO 的合作体验在各方面都很棒。凭借他们的专业知识和清晰沟通,我们开发出几种检测产品来检测组织中的 RNA 和短链寡核苷酸。与标准的互补探针相比,我们利用 ACD BIO 产品获得的信号不仅清晰,而且特异。在看了第一批图像后,我们马上意识到我们会更频繁地使用这些技术。”

—— Exicure公司的研发团队

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