生物通 | 新技术专栏

AGBT 2021:空间转录组学新品荟萃(上)

【字体: 时间:2021年03月10日 来源:生物通

编辑推荐:

  2021年度的基因组生物学与技术进展大会于3月1日至3日在线上举行。空间转录组学以及单细胞领域的进展备受关注。NanoString、10x Genomics、Vizgen、PacBio等公司纷纷介绍了他们的最新产品。

2021年度的基因组生物学与技术进展大会(AGBT 2021)于3月1日至3日在线上举行。AGBT大会被认为是基因组科学与技术领域最高水平的峰会之一。众多科学家和供应商参加了上周的会议,并分享了他们的最新工作和技术进展。

空间转录组学技术近年来进展迅速,为人们了解复杂组织提供了独特视角,去年也被《Nature Methods》杂志评为2020年度技术(Method of The Year)。因此,空间转录组学以及单细胞领域的进展备受关注。10x Genomics、NanoString、Vizgen、PacBio等公司纷纷介绍了他们的最新产品。

10x Genomics

10x Genomics的应用团队负责人Sarah Taylor此次在会上重点介绍了Chromium单细胞平台、Visium空间基因组学平台,以及未来即将推出的原位分析平台。

在1月份举办的摩根大通医疗健康年会上,10x Genomics曾表示将推出高通量的Chromium X单细胞分析平台,以及能够处理固定细胞的Chromium样本制备试剂盒。Taylor表示,这两个产品都有望在2021年下半年推出。

此外,她表示Chromium平台还能助力高通量的抗体发现,这种技术称为BEAM(barcode enabled antigen mapping)。利用BEAM技术,用户可在单次实验中分离不同物种的多个抗原的高特异性抗体。软件方案可在数天内从血液或淋巴结中分离出抗原特异性的抗体。BEAM技术有望在2022年上半年推出。

在空间基因组学方面,Taylor重申了2022年上半年将会交付Visium CytAssist仪器(将标准的组织学玻片转换成与Visium兼容的玻片)以及Visium HD平台(迄今为止最高分辨率的空间平台)。用户一直都期待Visium空间基因表达技术能与FFPE样本兼容。据介绍,Visium for FFPE试剂盒将在几个月内交付。

10x Genomics还会基于之前收购的ReadCoor和Cartana公司,开发出一款原位分析平台,适用于那些清楚自己的分析目标并希望以单分子分辨率关注特定目标的研究人员。该解决方案将会整合硬件、软件和试剂,实现多重的多组学分析,同时检测转录组学和蛋白质组学分析物。

Vizgen

Vizgen公司的首席执行官Terry Lo在AGBT大会上介绍了最新开发的MERSCOPE平台。这个平台将单细胞和空间基因组学分析整合在一个系统中,提供了一个从样本制备到数据可视化的简化流程,可广泛应用在基础生物学和医学领域。据介绍,MERSCOPE平台不仅能提供整张组织切片的空间背景,还能提供灵敏的单细胞基因表达谱分析。

MERSCOPE平台是基于大名鼎鼎的MERFISH(多重抗误差荧光原位杂交)技术。这项技术由霍华德-休斯医学研究所的庄小威博士开发。Vizgen公司在2019年获得了该技术的许可证。

MERSCOPE平台利用组合标签和连续成像来提高检测通量,并通过抗误差条形码策略来抵消单分子标记的错误。它能够对整块组织开展空间基因表达分析,并以纳米级的分辨率来解析单个转录本。每次运行可分析数十万个细胞中的数百个基因,而无需使用测序。Lo表示,Vizgen的可视化软件能够将所有图像处理成易于使用的输出文件。这些文件可通过Vizgen的工具查看,也可以利用其他工具进行分析。

Lo表示,MERSCOPE平台将在2021年夏天正式发售。(生物通 薄荷)

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 生物通商城 | 人才市场 | 核心刊物 | 特价专栏 | 仪器云展台 | 免费试用 | 今日视角 | 新技术专栏 | 技术讲座 | 技术期刊 | 会展中心 | 中国科学人 | 正牌代理商

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号