Nature丨揭秘SMART-Seq技术助攻:肿瘤细胞如何策反部分免疫细胞

【字体: 时间:2021年10月01日 来源:Takara

编辑推荐:

  这项研究使用Takara产品SMART-Seq HT Kit(Code No. 634456)分别对纯化的低糖亲和力(2NBDGlow)和高糖亲和力(2NBDGhigh)的Treg细胞亚群进行转录组分析,以进一步了解不同葡萄糖亲和力下Treg细胞的基因表达情况。

提到肿瘤细胞和免疫细胞,一般我们想象的画面是:英勇的T细胞像一个个战士,在人体内与肿瘤细胞斗智斗勇,以杀死肿瘤细胞保卫身体为终极目标。

所以按理说,肿瘤细胞和免疫细胞应该永远是仇人般刀兵相见,势不两立。但是也正如武侠世界里总有那么几个经不住诱惑而转身叛变的人。有这么一类免疫细胞,在狡猾的癌细胞的糖衣炮弹攻击下被成功策反,反过来帮助癌细胞逃避免疫系统的“追杀”。

2021年2月15日,美国匹兹堡大学的Greg M. Delgoffe教授团队在Nature上发表题为:Metabolic support of tumor-infiltrating regulatory T cells by lactic acid 的文章,证实肿瘤细胞不仅能通过剥夺效应T细胞的营养逃避“追杀”,还为“友军”调节性T细胞(Treg细胞)提供乳酸来对抗效应T细胞的杀伤作用。

文献概要

研究表明,Treg细胞虽然对维持免疫稳态至关重要,但因为肿瘤微环境(tumour microenvironment, TME)能够促进Treg细胞聚集、分化和激活,所以Treg细胞也是癌症免疫的主要障碍。肿瘤细胞代谢紊乱促使一个代谢物耗竭、缺氧和酸性的TME形成,因此浸润的效应T细胞要与肿瘤细胞竞争代谢产物,并受到TME中Treg细胞的强烈抑制作用。之前的研究结果表明Treg细胞与效应T细胞的代谢方式不同,所以作者猜想TME的代谢变化与Treg细胞活性增强相关。

研究发现,Treg细胞代谢灵活,通常被认为是糖酵解代谢副产物的乳酸,可以作为Treg细胞维持其高抑制能力的来源。阻止TME中Treg细胞摄取乳酸会减缓肿瘤生长并增加对免疫治疗的反应。

总的来说,Treg细胞能够在TME中使用“替代”代谢物来维持其免疫抑制特性。此外,研究结果表明,肿瘤细胞通过剥夺效应T细胞的营养,并通过代谢支持Treg细胞群来避免被“破坏”。

涉及的Takara产品

在该项研究中,使用Takara产品SMART-Seq HT Kit(Code No. 634456)分别对纯化的低糖亲和力(2NBDGlow)和高糖亲和力(2NBDGhigh)的Treg细胞亚群进行转录组分析,以进一步了解不同葡萄糖亲和力下Treg细胞的基因表达情况。

SMART-Seq HT Kit产品信息

▪ 流程更加简便,让您在科研路上更快一步!

SMART-Seq HT Kit是在经典的SMART技术的基础上进行了优化改良。搭载one-step RT-PCR技术,4小时内即可制备高品质的全长cDNA! 而且它兼容自动化移液工作站,采用oligo(dT)引物,支持1-100个细胞或10 pg-1 ng总RNA起始,可以更少的时间分析更多的样本!

▪ 保留全长基因信息,性能依然卓越!

SMART-Seq HT Kit保持了SMART技术一贯的高水准的单细胞cDNA合成性能,不仅提供全长转录本的信息,还支持分析转录本异构体、融合基因、点突变等内容。同时,价格更加亲民,具有比较高的性价比!

使用SMART-Seq v4试剂盒和SMART-Seq HT试剂盒从21个293T单细胞制备文库,然后进行测序分析。从上图可以看出,SMART-Seq v4试剂盒和SMART-Seq HT试剂盒在基因表达分析中没有显著的偏差!

新品推荐:SMART-Seq HT PLUS Kit(Code No. R400748)

为了使单细胞cDNA合成、文库构建实验“一步”到位,我们全新推出了SMART-Seq HT PLUS Kit。在包含核心的cDNA合成试剂基础上,同时整合了Takara Bio Group专利性的文库构建技术及单次使用的双端特殊index(UDI),提供完整的单细胞cDNA合成到文库构建的实验体验!

▪ 从高灵敏度、高重复性的cDNA合成出发,构建更高品质Illumina文库

数据来源于Takara Bio USA, Inc.

Takara科学家从10 pg小鼠脑total RNA起始,采用SMART-Seq HT Kit完成cDNA合成。随后分别使用SS-HT Plus Kit中的SMART-Seq Library Prep Kit模块与市面上较常用的A公司试剂盒构建文库,并比较性能差异。测试数据中可以看出,SS-HT PLUS Kit所建文库的产量是A公司Kit产量的5倍。并且SS-HT PLUS文库能比A公司文库多检出10%的基因,从同样的cDNA起始能“捕获”更全的信息!

了解更多详情请点击:
Takara Bio中国官网

订阅生物通快讯

订阅快讯:

最新文章

限时促销

会展信息

关注订阅号/掌握最新资讯

今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

版权所有 生物通

Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

联系信箱:

粤ICP备09063491号