【字体: 时间:2022年03月23日 来源:凯杰

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  QIAGEN在核酸纯化领域精耕细作多年,特别推出的PowerSoil Pro系列试剂盒配备了Beads Beating珠磨研磨管和升级抑制因子去除技术 (IRT) 是宏基因组研究中核酸提取的不二之选。

微生物组研究是一个激动人心的研究领域,正以指数级增速来拓展我们对微生物世界的了解。当微生物首次在18世纪的显微镜下被发现时,很少有人可以想象它们在地球上无所不在。它们参与物理环境和有机生物圈的调节,对人类健康和疾病的重要性在最近几十年也变得十分明显。宏基因组学为科学家提供了无需培养即可研究微生物遗传同质性的替代方法,可以帮助科学家更好地捕捉微生物群落中的极致多样性,当然,高质量的核酸是决定成败的关键之一。

QIAGEN在核酸纯化领域精耕细作多年,特别推出的PowerSoil Pro系列试剂盒配备了Beads Beating珠磨研磨管和升级抑制因子去除技术 (IRT, Inhibitor Removal Technology) 是宏基因组研究中核酸提取的不二之选。

土壤是微生物组研究中最常见的一类样本。土壤种类繁多,组分也相对复杂,微生物细胞紧紧吸附在土壤颗粒表面,易导致微生物裂解困难。PowerBead Pro珠磨研磨管可帮助分散土壤颗粒,优化的研磨珠粒径可有效提高微生物和研磨珠碰撞几率,相比同类产品DNA产量更高(图1)。研磨珠材质坚硬,可高效裂解任何类型的土壤样本中所有细菌、真菌和古菌助您获得更高的微生物丰度信息(图2)。


图1. 250mg堆肥、粘土、表层土壤样本用各类试剂盒抽提产量的比较。核酸用Qubit进行定量。

 
图2.  PowerSoil Pro Kit帮助获得更高的细菌OTUs。

土壤中含有大量动植物代谢产生的腐殖酸,腐殖酸也是亲水性的大分子阴离子聚合物,与核酸链紧密结合,无法通过简单的洗涤步骤彻底去除。第二代抑制因子去除技术无需在纯化过程中反复洗涤,室温一步混合后离心1分钟即可彻底去除所有腐殖酸。升级的IRT技术不受样本中抑制因子浓度高低影响,经IRT技术处理的DNA可获得A260/280比值接近1.8,A260/230比值接近2.0的稳定结果(图3)。所有经PowerSoil Pro系列试剂盒处理的土壤样本获得的高质量DNA可直接用于下游PCR、qPCR和NGS应用。

 
图3. 各款试剂盒抽提250mg土壤样本DNA质量比较。
A.  PowerSoil Pro Kit A260/280比值最接近1.8 
B.  PowerSoil Pro Kit A260/230比值最高

PowerSoil Pro系列试剂盒不仅可以帮您解决样本制备阶段面临的挑战,还提供硅胶膜和磁珠纯化技术以及高通量、自动化方案,全方位满足您的实验需求。

DNeasy PowerSoil Pro Kit
手工硅胶膜提取试剂盒,PowerBead Pro Tube珠磨研磨管与基于强劲三维震动技术的PowerLyzer 24均质裂解仪完美配合,数十秒内无差异裂解土壤样本中所有微生物,20分钟即可获得展现最真实微生物丰度比的高质量核酸。

DNeasy 96 PowerSoil Pro Kit
高通量手工硅胶膜提取试剂盒,包含96孔板式PowerBead Pro Plate和纯化柱,配合TissueLyser ll 均质裂解仪可以一次手工处理高达96个表层土壤、堆肥、粘土、粪便和肠道样本。强烈推荐搭配QIAVac 96真空底座来替代离心步骤,实现更高效的高通量手工纯化。

DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit
高通量自动化硅胶膜提取试剂盒,可在QIAcube HT高通量仪器上灵活实现8-96个样本的自动纯化,结果可靠更省心。还能根据需要处理的样本数量灵活搭配单个PowerBead Pro Tube或96孔板式PowerBead Pro Plate。

MagAttract PowerSoil Pro DNA Kit
手工磁珠法提取试剂盒,特别针对黏稠或易堵膜样本,磁珠纯化更省力。同样可根据需要处理的样本数量灵活搭配单个PowerBead Pro Tube或96孔板式PowerBead Pro Plate,搭配磁力架,灵活满足1-96个样本快速纯化。

QIAsymphony PowerFecal Pro DNA Kit
高通量自动化磁珠法提取试剂盒,可在QIAsymphony全自动磁珠纯化平台实现一批次24个样,一次运行高达4批次纯化各类土壤、粪便及肠溶物等样本中微生物核酸,使核酸纯化解放双手不再是梦。

作为PowerSoil Pro家族的成员,高通量纯化试剂盒秉承了Pro家族一贯优点:高通量的同时确保获得的高质量核酸优于同类试剂盒(图4)。


图4. 250mg森林和公园土壤样本用各类试剂盒抽提产量的比较。核酸用Qubit进行定量。

QIAGEN不仅拥有PowerSoil Pro系列试剂盒优化的珠磨研磨方案和升级的抑制因子去除技术助您解决了微生物样本核酸制备阶段面临的偏差、产量和抑制剂这三大挑战,同时还为您准备了宏基因组研究完整解决方案助力您精准破解土壤微生物密码。

土壤宏基因组整体解决方案


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