“RNA fishing”揭示了黑色素瘤恶性肿瘤和转移的新驱动力

【字体: 时间:2022年08月05日 来源:Nucleic Acids Research

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  基因组调控中心(CRG)的研究人员已经确定了几种参与黑色素瘤进展的蛋白质。其中一种蛋白质PDIA6被发现在驱动恶性肿瘤方面特别重要。小鼠实验表明,PDIA6水平降低的黑色素瘤细胞转移到肺的能力受损。发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志上的这一发现,可能会导致新的治疗策略,防止黑色素瘤从身体的一个部位扩散到另一个部位。

  

基因组调控中心(CRG)的研究人员已经确定了几种与黑色素瘤(最致命的皮肤癌)的发展有关的蛋白质。其中一种蛋白质PDIA6被发现在驱动恶性肿瘤方面特别重要。小鼠实验表明,PDIA6水平降低的黑色素瘤细胞转移到肺的能力受损。

研究人员发现PDIA6通过与肿瘤细胞内的RNA分子结合,促进了黑色素瘤恶性肿瘤的发生。在“La Caixa”基金会的支持下,这项发表在《核酸研究》杂志上的研究的作者确定了PDIA6表面上与RNA分子结合的区域。通过进一步的研究,这些信息可以帮助设计新的治疗化合物,防止黑色素瘤从身体的一个部位扩散到另一个部位。

此前,PDIA6与淋巴瘤、乳腺癌和肺癌的进展有关。如果进一步的研究发现PDIA6也与这些其他癌症类型的RNA结合,它可能会导致针对不同肿瘤的相同作用机制的治疗策略。

这一发现之所以成为可能,要归功于一种专门用于识别RNA结合蛋白的“RNA fishing”技术。这是一类执行多种生物功能的蛋白质,在癌症中,通过帮助细胞适应变化的环境和快速应对外部威胁,赋予细胞弹性,促进恶性肿瘤和治疗的耐药性。

这项技术,也被称为RNA相互作用组捕获,涉及到在一个细胞中捞出所有的信使RNA。然后,研究人员观察哪些蛋白质附着在细胞上,从而了解细胞内发生的rna结合活动的水平和多样性。

“RNA结合蛋白具有很大的治疗意义。这项研究中的技术可以帮助我们测量它们的活动,这是传统方法无法在如此大规模的全球范围内实现的。当用于比较肿瘤细胞和非肿瘤细胞时,这种方法帮助我们确定哪些蛋白质可能在癌症进展中发挥重要作用,并进行进一步的实验告诉我们它们是如何工作的。我们利用这个蓝图发现了黑素瘤的新弱点,我们希望这可以重复来发现其他类型癌症的新治疗靶点,”Fátima Gebauer博士解释说,他是CRG的研究员和该研究的资深作者。

在这项技术鉴定出的数百种rna结合蛋白中,研究人员选择了24种使用不同的标准进行进一步分析,例如,因为它们的rna结合活性尚未被描述,或者它们以前与癌症进展没有联系。研究人员挑选出PDIA6来进一步表征其功能,包括在小鼠模型中进行移植实验。未来的研究可能会深入研究发现的其他23种蛋白质的作用。

“我们只是触及了rna结合蛋白作为治疗靶点的潜力的表面。Gebauer博士总结道:“通过功能性方法确定rna结合活性,然后详细了解它们的能力,将为设计抑制剂铺平道路,这可能大大改善癌症的个性化治疗。”

这项研究是与德国哈雷大学和英国牛津大学合作进行的,并得到了Caixa基金会通过caixresearch Health赠款的支持。该项目始于2014年,由“La Marató de TV3”资助。

文章标题

黑色素瘤rbpoome鉴定显示PDIA6是一种非常规的rna结合蛋白,参与转移



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