现在的检测技术能否检测出未来SARS-CoV-2变种?Cell一项新研究给出了答案

【字体: 时间:2022年09月19日 来源:Cell

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  快速抗原检测的可用性极大地推动了遏制COVID-19传播的努力,但每一种新的担忧都引发了诊断检测是否仍然有效的问题。发表在《细胞》杂志上的一项新研究试图解决这些问题,方法是评估在未来的SARS-CoV-2变种挑战下,检测的速度如何。

  

快速抗原检测的可用性极大地推动了遏制COVID-19传播的努力,但每一种新的担忧都引发了诊断检测是否仍然有效的问题。发表在《细胞》杂志上的一项新研究试图解决这些问题,方法是评估在未来的SARS-CoV-2变种挑战下,检测的速度如何。

该研究团队由埃默里大学领导,由美国国立卫生研究院(NIH)快速加速诊断(RADx)技术项目资助,开发了一种新的方法,用于评估新冠病毒的突变如何影响快速抗原检测中使用的抗体的识别。因为大多数快速抗原检测都是检测SARS-CoV-2核衣壳蛋白(N蛋白),该团队直接测量了N蛋白的突变如何影响诊断抗体识别目标的能力。

埃默里大学生物化学系助理教授、第一篇研究报告的作者Filipp Frank博士说:“根据我们的发现,令人担忧的SARS-CoV-2的主要变体都不包含会影响当前快速抗原检测抗体能力的突变。此外,这些数据使我们能够提前一步,针对可能出现的几乎任何变体预测测试性能。”

该研究使用了一种称为深度突变扫描(Deep mutational scanning)的方法,在一个单一的高通量实验中评估N蛋白中所有可能的突变。然后,研究人员测量了突变对它们与11种商用快速抗原检测中使用的抗体相互作用的影响,并确定了可能导致抗体逃逸的突变。

埃默里大学生物化学系教授、资深研究作者Eric Ortlund博士说:“准确和有效地识别受感染者仍然是减缓COVID-19的一项至关重要的策略,我们的研究提供了关于未来可能干扰检测的SARS-CoV-2突变的信息。这里概述的结果可以让我们快速适应病毒的新变种继续出现,代表着立即的临床和公共卫生影响。”

研究结果表明,变异中N蛋白发生突变从而躲过诊断测试的情况相对罕见,但有一小部分序列可能会影响检测。研究人员、公共卫生官员和测试制造商可以使用这些数据来确定诊断测试是否需要评估其检测这些突变的能力,或为未来的测试设计提供信息。

国家生物医学成像和生物工程研究所(NIBIB)主任、NIH RADx?技术项目负责人Bruce J. Tromberg博士说:“考虑到新变体的无尽循环,这项研究的数据在未来几年将是有用的。”

虽然许多担忧的变体包含N蛋白的多重突变,但研究作者指出,他们的方法没有评估多重突变如何影响诊断抗体识别,这代表了该研究的局限性。

文章标题

Deep mutational scanning identifies SARS-CoV-2 Nucleocapsid escape mutations of currently available rapid antigen tests


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