《Nature》连发两文:新技术“FIND-seq”探测到了以前难以分辨的细胞们

【字体: 时间:2023年01月06日 来源:Nature

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  来自布莱根的一组研究人员开发了FIND-seq工具,该工具使他们能够详细分析罕见的细胞群。

  

罕见的细胞类型会对人体健康产生不适当的影响。先前的研究表明,星形细胞的一个子集——大脑和脊髓中的星形细胞——可能是导致多发性硬化症(MS)的原因,这是一种免疫系统攻击保护神经的覆盖物的疾病。但是找到这些罕见的细胞并不是一件容易的事情——为了精确定位它们,研究人员需要识别出独特的表面标记,从而将这些罪魁祸首细胞与其他细胞区分开。单细胞RNA测序可以帮助找到它们,即使在没有区分表面标记的情况下,但这种技术可能会变得非常昂贵。

为了解决这一问题,由布里格姆妇女医院(Brigham and Women’s Hospital)的研究人员领导的一个团队,该医院是布里格姆医疗保健系统的创始成员之一,他们开发了一种结合了核酸细胞术、微流体和液滴分类的FIND-seq,根据数字液滴PCR检测到的mRNA生物标志物的表达,分离和分析感兴趣的罕见细胞。利用这种方法,研究小组详细分析了驱动中枢神经系统炎症和神经退行性变的星形胶质细胞群。当与其他工具联合使用时,FIND-seq确定了由矿物皮质激素受体NR3C2和核受体辅抑制因子2控制的信号通路,这些信号通路在小鼠和人类致病星形胶质细胞的发育中发挥重要作用。在另一项研究中,研究人员使用FIND-seq来确定艾滋病毒在接受抗逆转录病毒治疗的患者的免疫细胞中“隐藏”的机制。

BWH神经内科的通讯作者Francisco Quintana博士说:“这些发现为神经系统疾病(如MS)的治疗干预确定了新的靶点。”该团队正在努力开发新的小分子,可以用于治疗这种途径。

FIND-Seq的文章,并在同一期发表的一篇配套论文中阅读有关它在HIV研究中的应用。

原文检索:

1.Identification of astrocyte regulators by nucleic acid cytometry

2.HIV silencing and cell survival signatures in infected T cell reservoirs


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