整合代谢组学和转录组学分析确定了调控高地棉花（Gossypium hirsutum）关键代谢物和农艺性状的MYB基因

《Nature Genetics》：Integrated metabolomic and transcriptomic analyses identify MYB genes regulating key metabolites and agronomic traits in upland cotton Gossypium hirsutum

解析棉花胚珠多组学数据发现代谢与表达QTL关键基因调控纤维发育和产量

　　

摘要

了解早期胚胎发育对于揭示植物细胞分化和器官发生机制至关重要。在这项研究中，我们整合了来自403个陆地棉胚珠的多组学数据，共鉴定出2,960个代谢定量性状位点和24,485个表达定量性状位点。其中一个关键位点为ME_A07，它影响着252种已知代谢物的水平以及4,293个基因的表达；其中MYB基因GhTT2_A07被确定为该位点的核心调控因子，可能受到一个长度为520 kb的倒位基因的影响。GhTT2_A07同时调控着初级和次级代谢物的合成，从而影响农艺性状。另一个位点ME_A06由MYB基因Proanthocyanidin Regulator（GhPAR）调控，该基因能够调节原花青素的含量，暗示着某种生态适应性。GhTT2_A07和GhPAR表现出既有共同特征又有差异的表达模式，对纤维质量和产量产生不同程度的影响。这些发现突显了MYB基因在棉胚珠和纤维早期发育中的关键作用，并为棉花研究和分子育种提供了全面的多组学资源。