冻干技术提高了植物多组学研究中代谢物与蛋白质联合提取的效率

《PROTEOMICS》：Lyophilization Improved Efficiency in 2-in-1 Metabolite and Protein Extraction for Plant Multi-Omics

植物多组学整合研究中，开发了一种同时提取代谢物和蛋白质的高效方法，利用同一植物样本实现多组学数据整合。该方法通过冷冻干燥样本处理显著提升蛋白质提取效率（验证于不同组织及物种），并创新性采用预处理代谢物步骤消除传统沉淀环节，使全流程可在2小时内完成，为植物系统生物学研究提供标准化解决方案。

摘要

集成组学的最新进展开启了一个新时代，其特征是对生物体内的大量基因和分子进行系统的鉴定和功能分析。为了实现多组学数据的无缝整合，最好在不同的组学分析中使用相同的样本，因为来自同一样本的数据能够产生一致的结果。在这项研究中，我们开发了一种从相同植物样本中提取代谢物和蛋白质的方法。值得注意的是，冻干样本的蛋白质提取效率高于新鲜样本，这一趋势在包括叶片、茎、花朵、种子和根在内的各种植物组织中得到了验证，同时也适用于不同的植物物种。此外，预先提取代谢物后，就无需再进行TCA/丙酮沉淀处理，从而可以直接使用溶解溶液进行蛋白质提取，这种方法既可行又有效。优化后的方法使我们能够在2小时内完成代谢物和蛋白质的提取，同时保持高质量和高产量。该方法在未来的植物集成组学研究中具有广泛的应用前景。

总结

高通量多组学技术将植物系统生物学提升到了一个新的水平。为了满足样本制备的需求，我们开发了这种集代谢物和蛋白质提取于一体的方法。该方法的主要特点包括：1) 可以在2小时内从同一样本中提取代谢物和蛋白质；2) 冻干样本的蛋白质提取效率高于新鲜冷冻样本。这种方法促进了高通量多组学研究和数据整合。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。