《Journal of Plant Pathology》：Nearly complete genome sequence and molecular characterization of a new putative deltapartitivirus infecting carnation in Iran
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藏红花无症状感染中通过高通量测序发现新分节病毒科病毒DcCV1，基因组含三段双链RNA分别编码RNA聚合酶P1、衣壳蛋白P2及未知功能蛋白P3，5’UTR保守序列与德尔塔分节病毒属相似，依据物种划分标准建立新物种Deltapartitivirus dianthicrypticum，并采用RT-PCR结合测序验证其存在性，系该观赏植物第四种潜藏病毒报告。
摘要
通过高通量测序（HTS）在无症状的康乃馨（Dianthus caryophyllus，L.）中检测到一种属于Partitiviridae科的新病毒。该病毒被暂时命名为Dianthus caryophyllus cryptic virus 1（DcCV1），其暂定的种名为Deltapartitivirus dianthicrypticum。其基因组由三段双链RNA（dsRNA）组成，长度分别为1657、1496和1435个核苷酸。最长的dsRNA编码P1蛋白（477个氨基酸），该蛋白被鉴定为病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RDRP），并含有六种双链RNA病毒RDRP特有的保守结构域。第二段dsRNA编码P2蛋白（347个氨基酸），即衣壳蛋白（CP）；第三段dsRNA编码P3蛋白（347个氨基酸），但其功能尚不清楚。这三段dsRNA的5’非翻译区都含有一个高度保守的9个核苷酸序列（5’ GATAATGAT 3’），这一序列与某些deltapartitiviruses的5’非翻译区（UTR）相似。根据Partitiviridae科的物种划分标准，Deltapartitivirus dianthicrypticum被提议作为一个新物种。使用针对CP基因的特异性引物（1044 bp）进行RT-PCR后，再通过测序验证了DcCV1在康乃馨植株中的存在。这是首次在康乃馨中发现DcCV1，也是这种观赏植物中发现的第四种隐匿病毒。
通过高通量测序（HTS）在无症状的康乃馨（Dianthus caryophyllus，L.）中检测到一种属于Partitiviridae科的新病毒。该病毒被暂时命名为Dianthus caryophyllus cryptic virus 1（DcCV1），其暂定的种名为Deltapartitivirus dianthicrypticum。其基因组由三段双链RNA（dsRNA）组成，长度分别为1657、1496和1435个核苷酸。最长的dsRNA编码P1蛋白（477个氨基酸），该蛋白被鉴定为病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RDRP），并含有六种双链RNA病毒RDRP特有的保守结构域。第二段dsRNA编码P2蛋白（347个氨基酸），即衣壳蛋白（CP）；第三段dsRNA编码P3蛋白（347个氨基酸），但其功能尚不清楚。这三段dsRNA的5’非翻译区都含有一个高度保守的9个核苷酸序列（5’ GATAATGAT 3’），这一序列与某些deltapartitiviruses的5’非翻译区（UTR）相似。根据Partitiviridae科的物种划分标准，Deltapartitivirus dianthicrypticum被提议作为一个新物种。使用针对CP基因的特异性引物（1044 bp）进行RT-PCR后，再通过测序验证了DcCV1在康乃馨植株中的存在。这是首次在康乃馨中发现DcCV1，也是这种观赏植物中发现的第四种隐匿病毒。
