年龄重塑乳腺癌微环境:单细胞解析揭示TNBC与ER+亚型差异的分子蓝图

【字体: 时间:2025年11月05日 来源:Nature Aging 19.4

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  本研究针对年龄对乳腺癌肿瘤微环境(TME)细胞状态的影响这一空白,通过开发ASPEN(Age-Specific Program ENrichment)分析框架,整合单细胞转录组、空间转录组及多组学数据,系统解析了TNBC(三阴性乳腺癌)和ER+(雌激素受体阳性)乳腺癌中年龄相关的细胞特异性转录程序、细胞互作网络及信号通路。研究发现,老年TNBC患者肿瘤上皮细胞上皮-间质转化(EMT)增强且免疫抑制信号活跃,而老年ER+乳腺癌表现为血管代谢功能下降和T细胞衰竭。空间分析验证了年龄特异的细胞空间分布差异,为开发年龄适应性治疗策略提供了新靶点。

随着全球人口老龄化加剧,年龄已成为乳腺癌发生发展和治疗反应的关键影响因素。临床数据显示,相较于55-64岁的患者,年轻(<45岁)和老年(>65岁)乳腺癌患者预后更差,且这种差异跨越分子亚型。尤其值得注意的是,老年患者虽占乳腺癌病例的大多数,却在临床试验中代表性不足,导致真实世界疗效与试验结果脱节。当前治疗策略常因耐受性、合并症等因素对不同年龄群体进行调整,但年龄如何塑造肿瘤微环境(TME)的细胞状态,进而驱动病理进展,仍不明确。
为破解这一难题,研究人员在《Nature Aging》上发表了最新成果,通过多组学整合分析,首次在单细胞分辨率下描绘了人乳腺癌TME的年龄相关分子图谱。
研究团队首先利用METABRIC和TCGA数据库的批量转录组数据,比较了年轻与老年TNBC(或基底样)及ER+(或管腔A型)乳腺癌的差异表达基因(DEGs)。在TNBC/基底样肿瘤中,老年患者富集了免疫相关通路(如抗原呈递、干扰素-γ信号),而年轻患者富集细胞周期和致癌信号。在ER+/管腔A型肿瘤中,老年患者ESR1(编码雌激素受体α)表达升高,但年轻患者富集乳腺生物学和促有丝分裂信号。
为深入解析细胞特异性变化,团队开发了ASPEN(Age-Specific Program ENrichment)分析流程,该流程结合基因集富集分析(GSEA)和特征评分算法,将功能通路富集与年龄进行关联。
应用ASPEN于人类乳腺癌单细胞图谱数据(10例TNBC, 11例ER+),发现细胞比例无显著年龄差异,但转录程序迥异。在TNBC中,老年患者癌症上皮细胞EMT程序最强富集,且伴随免疫反应、KRAS信号、凋亡等增强,氧化磷酸化(OXPHOS)等减弱。多重免疫荧光(mIF)在独立TNBC队列中证实老年组panCK(上皮标志)与vimentin(间质标志)共定位显著增加。
在ER+乳腺癌中,大多数年龄相关程序(ARPs)在年轻患者中富集,特别是血管、浆母细胞和CD8+ T细胞中的代谢过程。老年患者则显示癌细胞IFN反应减弱、髓系细胞TNF信号增强、T细胞代谢功能障碍。mIF分析显示年轻患者肿瘤内皮细胞COX4(氧化磷酸化关键蛋白)表达更高。
细胞互作分析(CellChat)揭示,老年TNBC细胞间相互作用总数和强度均增加,癌细胞与CD8+ T细胞、巨噬细胞互作增强;空间mIF显示老年组更多CD8+ T细胞邻近癌细胞。老年ER+乳腺癌中,癌细胞与髓系、T细胞互作概率升高,而血管内皮与周细胞样细胞(PVL)互作在年轻组富集。
信号网络分析进一步识别出年龄偏倚的关键信号节点。在TNBC老年组中,GALECTIN(如LGALS9/P4HB)、PPIA/BSG、PLAU/PLAUR等信号在髓系细胞、CAFs与癌细胞间激活,促进EMT和免疫抑制(如Treg招募)。在ER+乳腺癌老年组中,层粘连蛋白、纤维连接蛋白等ECM相关信号富集,MIF信号抑制T细胞活性。
关键实验技术方法概览
研究主要依托公共数据库(METABRIC、TCGA)和已发表单细胞数据集(GEO: GSE176078),结合自主开发的ASPEN计算流程,对乳腺癌单细胞转录组进行年龄关联分析;实验验证采用多重免疫荧光(mIF)技术对独立临床队列(包括ELEVATE、ADVANCE研究及医院存档组织构建的组织微阵列TMA)的福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行蛋白标志物空间分布量化;细胞互作及信号通路推断借助CellChat算法;统计检验涵盖差异表达分析(limma包)、基因集富集分析(GSEA)、相关性分析及非参数置换检验等。
研究结果详述
1. 年龄相关基因表达谱系
  • 批量转录组分析揭示TNBC老年组免疫通路激活,年轻组细胞周期信号富集;ER+老年组ESR1高表达,年轻组乳腺生物学通路活跃。
2. ASPEN框架揭示细胞特异性年龄程序
  • TNBC老年组癌细胞EMT最强富集,CAFs和T细胞炎症反应及应激应答增强;ER+老年组血管代谢功能下降,T细胞呈现衰竭表型。
3. 空间验证年龄相关表型
  • mIF证实TNBC老年组上皮-间质标志共定位增加;ER+年轻组血管内皮代谢活性更高。
4. 年龄差异化细胞互作网络
  • TNBC老年组细胞互作强度增加,癌细胞与免疫细胞邻近性提高;ER+老年组癌细胞-免疫细胞互作增强,年轻组血管-基质互作活跃。
5. 关键信号通路驱动年龄偏见表型
  • TNBC老年组GALECTIN、MHC II等信号促进EMT及免疫抑制;ER+老年组ECM重塑及MIF信号抑制抗肿瘤免疫。
结论与展望
本研究通过跨尺度整合分析,构建了年龄分辨的乳腺癌TME细胞图谱,明确年龄效应具有亚型特异性。在TNBC中,老年患者EMT及免疫抑制通路激活可能驱动不良预后;在ER+乳腺癌中,代谢衰退和免疫功能障碍或影响治疗响应。ASPEN框架具扩展性,可推广至其他组织或连续变量关联分析。研究成果强调“年龄适应性”治疗策略的必要性,如靶向老年TNBC的EMT相关通路或老年ER+的代谢支持疗法,为精准肿瘤学注入新维度。

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