通过免疫信息学方法，针对鲑鱼微孢子虫（Piscirickettsia salmonis）的潜在毒力因子进行疫苗开发

《Aquaculture International》：Targeting potential virulence factors of Piscirickettsia salmonis for vaccine development through an immunoinformatics approach

研究基于反向疫苗学方法，从P. salmonis中筛选出TolC、BamB、LptD和OmpA四个致病相关蛋白，通过免疫信息学预测并优化T细胞和线性B细胞表位，构建连接肽修饰的多表位疫苗候选体。经Expasy ProtParam、AlphaFold和GalaxyRefine进行理化特性、三维结构及稳定性分析，结合分子对接验证与TLR5受体的稳定结合，证实该疫苗设计可有效激发免疫应答，为新型亚单位疫苗开发提供理论依据。

　　

摘要

沙门氏菌（Piscirickettsia salmonis）是引发鱼立克次体病的病原体，这种疾病对水产养殖业，尤其是鲑鱼养殖业构成了重大威胁。尽管已有商业疫苗可用，但现有的预防措施效果有限，这凸显了开发更有效、新一代疫苗策略的迫切需求。在这项研究中，选取了沙门氏菌的四种与毒力相关的蛋白质（TolC、BamB、LptD和OmpA），采用基于免疫信息学的反向疫苗学方法设计了一种多表位疫苗。研究人员识别并根据抗原性和致敏性对这些蛋白质的表位进行了排序。选定的表位通过连接子组装成一种嵌合疫苗结构，以确保其能够正确折叠并能够被蛋白酶切割。通过Expasy ProtParam进行物理化学分析、使用AlphaFold进行三级结构建模，并通过GalaxyRefine进行优化，来评估该疫苗结构稳定性。在完成结构质量控制后，进行了大西洋鲑鱼TLR5与该疫苗结构的分子对接研究，随后进行了正常模式分析、结构灵活性分析以及免疫反应分析。鉴于该疫苗结构与TLR5的稳定相互作用，我们的研究结果表明该疫苗结构具有开发新型亚单位疫苗的潜力，有望用于对抗沙门氏菌。