综述:疾病中的赖氨酸乳酰化修饰:超越组蛋白乳酰化

《Cell Death & Disease》:Lysine lactylation in diseases: beyond histone lactylation

【字体: 时间:2025年11月26日 来源:Cell Death & Disease 9.6

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  本综述系统阐述了乳酸驱动的赖氨酸乳酰化(Kla)这一新型蛋白质翻译后修饰(PTM)在炎症、感染、神经退行性疾病、心血管疾病及癌症等病理过程中的关键作用。文章重点揭示了Kla修饰如何通过调控转录因子(TF)活性、代谢酶功能、DNA损伤修复及RNA代谢(如m6A/m5C)等精确机制,超越组蛋白表观遗传调控,成为连接细胞代谢与疾病表型的核心桥梁,为靶向Kla网络的新型治疗策略提供了理论依据。

  
在细胞代谢与疾病发生发展的交叉领域,乳酸已从单纯的代谢废物演变为关键的信号分子。其介导的赖氨酸乳酰化(Kla)修饰,自2019年在组蛋白H3的K18位点(H3K18la)上被首次报道以来,迅速成为生命科学研究的焦点。这篇综述将带领我们跨越组蛋白的范畴,深入探索功能性蛋白质的Kla修饰在人类重大疾病中的精密调控网络。
炎症中的功能性蛋白质Kla修饰
当机体遭遇组织损伤或外界刺激时,炎症反应是首道防线。然而,持续的炎症会引发“细胞因子风暴”,导致器官衰竭。在炎症组织中,免疫细胞的代谢重编程导致乳酸堆积,进而驱动关键蛋白质的Kla修饰,精细调控炎症进程。
例如,转录因子EGR1和TWIST1的Kla修饰能促进其核转位,分别激活肝素酶和促炎细胞因子的基因转录,加剧肺损伤和皮肤纤维化。YY1的乳酰化则能增强其转录活性,促进STAT3、CCL5等促炎基因的表达。在代谢层面,ATP柠檬酸裂解酶的长亚型(Acly-L)发生Kla修饰后,其酶活受到抑制,从而减少了IL-1β和IL-6的产生,缓解了类风湿关节炎。相反,脂肪酸合酶(FAS)的K673位点乳酰化会抑制其活性,通过代谢应激信号削弱线粒体功能,反而缓解了非酒精性脂肪肝的症状。
此外,E3泛素连接酶NEDD4的Kla修饰会抑制其对caspase-11的泛素化,从而激活细胞焦亡,加重肝损伤。信号转导蛋白Ezrin的乳酰化可激活NF-κB通路,诱导线粒体分裂蛋白Fis1的Kla修饰则导致ATP耗竭和活性氧(ROS)爆发,共同促进细胞凋亡和肾损伤。有趣的是,RelA的D-乳酰化却能抑制其转录活性,减少促炎因子产生,帮助恢复免疫稳态,展现了Kla修饰的双面性。
感染性疾病中的功能性蛋白质Kla修饰
病原体感染会激活宿主细胞的糖酵解途径,导致乳酸积累。病原体与宿主利用Kla修饰展开了一场激烈的“军备竞赛”。
一方面,病毒会巧妙地利用宿主的高乳酸环境。人巨细胞病毒(HCMV)感染可导致病毒DNA传感器IFI16发生Kla修饰,抑制其与DNA-PK的结合,从而帮助病毒逃避宿主免疫应答。卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)则能诱导宿主细胞中N-乙酰转移酶10(NAT10)的Kla修饰,增强其病毒RNA的稳定性,促进病毒复制。m6A阅读器蛋白YTHDF1的乳酰化会促使其降解,从而稳定病毒mRNA。
另一方面,宿主细胞也会利用Kla修饰进行反击。m6A去甲基酶ALKBH5的Kla修饰增强了其与IFNB mRNA的结合,促进I型干扰素的产生,抑制病毒复制。此外,RUBCN的自噬调节蛋白发生Kla修饰后,能增强与VPS34的相互作用,促进LAPosome的形成,从而提升巨噬细胞的抗菌能力。然而,乳酸环境也会促使环状GMP-AMP合成酶(cGAS)发生Kla修饰,使其丧失感知DNA的能力,抑制cGAS-STING通路激活,为病原体免疫逃逸提供可乘之机。
神经系统疾病中的功能性蛋白质Kla修饰
神经系统疾病,如阿尔茨海默病(AD)和脑卒中,对全球健康构成严重威胁。Kla修饰在其中的作用逐渐清晰。
在AD中, Tau蛋白的K331位点乳酰化不仅增强了其对GSK-3β和caspase-2介导的磷酸化与切割的敏感性,还竞争性抑制了同一赖氨酸位点的泛素化,减少了Tau蛋白的降解,导致神经纤维缠结(NFTs)的积累,加速疾病进程。Tau的K677位点乳酰化还能调节铁代谢,促进铁死亡,加剧神经元损伤。相反,淀粉样前体蛋白(APP)的Kla修饰却可能促进其通过内体-溶酶体途径降解,减少Aβ的产生,发挥保护作用。
在脑卒中模型中,星形胶质细胞中的囊泡运输蛋白ARF1发生Kla修饰后,会抑制其将健康线粒体传递给神经元的功能,导致神经元线粒体功能障碍。在创伤性脑损伤(TBI)中,调控线粒体自噬的关键因子Tufm的Kla修饰会抑制其与线粒体外膜蛋白Tomm40的相互作用,阻碍线粒体自噬,加剧神经元凋亡。而令人振奋的是, anaerobic exercise产生的乳酸能促进神经元中突触小体相关蛋白91(SNAP91)的Kla修饰,改善内侧前额叶皮层(mPFC)的突触结构,从而缓解焦虑症。
心血管疾病中的功能性蛋白质Kla修饰
心血管疾病(CVD)是全球头号死因。缺氧、炎症等应激状态导致心肌细胞乳酸水平升高,进而通过Kla修饰影响疾病进程。
其中,有害的Kla修饰包括:转录因子Snail1的乳酰化促进其核转位,激活TGF-β/Smad2通路,诱导内皮-间质转化(EndoMT),导致冠状动脉弹性降低和血管生成受损,加重心肌梗死。在心肌细胞中,脯氨酰4-羟化酶β亚基(P4HB)的K311位点乳酰化增强了它与环氧合酶2(PTGS2)的相互作用,通过PTGS2-SH3GLB1轴诱导线粒体活性氧(mitoROS)爆发和线粒体自噬,加剧放射性心脏病(RIHD)。苹果酸脱氢酶2(MDH2)的Kla修饰则会损害线粒体功能,诱导心肌细胞铁死亡。
然而,保护性的Kla修饰同样存在。缺血再灌注损伤(IRI)中,丝氨酸蛋白酶抑制剂Serpina3k(SA3K)的Kla修饰增强了其稳定性,通过旁分泌作用激活心脏保护信号通路,抵抗细胞凋亡。α-肌球蛋白重链(α-MHC)的乳酰化有助于维持其与肌联蛋白(titin)的相互作用,稳定心肌细胞结构,其在心力衰竭患者中的水平下降提示了其保护作用。更有趣的是,运动诱导的乳酸能促使甲基-CpG结合蛋白2(MeCP2)发生Kla修饰,促进其与H3K36me3结合,抑制RUNX1转录,推动巨噬细胞向修复性的M2型极化,从而预防动脉粥样硬化。
癌症中的功能性蛋白质Kla修饰
癌细胞的瓦博格效应(Warburg effect)导致肿瘤微环境(TME)中乳酸大量积累,使得Kla修饰在癌症中扮演着尤为突出的角色。它广泛参与肿瘤增殖、代谢重编程、DNA损伤修复、免疫逃逸和治疗抵抗。
在转录调控层面,胃癌中TEAD和YAP的Kla修饰增强了YAP-TEAD复合体的稳定性与转录活性,激活氨基酸-tRNA合成酶1(AARS1)的表达,而AARS1本身又能作为乳酰转移酶进一步乳酰化YAP和TEAD,形成正反馈,驱动肿瘤发生。在肝癌中,着丝粒蛋白A(CENPA)的K124位点乳酰化促进了CENPA-YY1复合物的形成,激活CCND2和NRP2等基因的转录,促进肿瘤生长和血管生成。
在DNA损伤修复方面,胶质母细胞瘤干细胞(GSCs)中,X射线修复交叉互补蛋白1(XRCC1)的K247位点乳酰化促进了其核转位,增强了DNA损伤修复能力,导致放疗抵抗。同样,MRE11的K673位点乳酰化也增强了其DNA结合能力,介导DNA损伤修复。
Kla修饰还深度参与RNA代谢调控。在肝细胞癌(HCC)中,m6A阅读器IGF2BP3的K76位点乳酰化增强了其与PCK2和NRF2 mRNA的结合,导致仑伐替尼耐药。在结直肠癌(CRC)中,组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)的K412位点乳酰化降低了RNA去甲基酶FTO和ALKBH5的水平,增加了FSP1 mRNA的m6A修饰,上调铁死亡抑制蛋白FSP1,抑制铁死亡。而m5C甲基转移酶NSUN2在胆管癌(CG)中的K508位点乳酰化显著增强了其活性,提高了GCLC mRNA的稳定性,促进谷胱甘肽(GSH)合成,从而抵抗铁死亡。
此外,Kla修饰直接调控蛋白质合成(如eEF1A2的K408位点乳酰化促进核糖体翻译)和免疫检查点蛋白的稳定性(如PD-L1的Kla修饰抑制其泛素化降解,促进肿瘤免疫逃逸),全方位助力肿瘤的恶性进展。
结论与展望
Kla修饰作为一种新兴的PTM,在多种疾病的病理生理过程中扮演着核心角色。与组蛋白Kla修饰的广泛转录调控不同,功能性蛋白质的Kla修饰往往具有更高的靶标特异性,通过影响转录因子活性、酶功能、信号转导、RNA代谢和蛋白质稳定性等精确机制发挥作用。这些修饰在疾病中常呈现“双刃剑”特性,既可促进疾病进展,也在特定情况下发挥保护作用。
未来研究需着重于:鉴定更多功能性蛋白质的Kla修饰位点并阐明其生物学功能;发现和表征负责催化Kla的“书写器”(writer)和“擦除器”(eraser”)酶;揭示Kla与其他PTM(如乙酰化、泛素化)之间的交互对话(crosstalk);以及开发靶向特定Kla修饰通路的高选择性小分子抑制剂。尽管将Kla靶向治疗推向临床面临挑战,但针对功能性蛋白质Kla修饰的精准干预策略,无疑为未来疾病治疗开辟了充满希望的新方向。
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