哥伦比亚保护区内农场动物景观配置与肠道寄生虫及真菌多样性的关系：对野生动物的流行病学风险

《Acta Parasitologica》：Relationship of the Landscape Configuration with the Gut Parasites and Fungi Diversity in Farm Animals Associated with Conservation Areas in Colombia: Epidemiological Risk to Wildlife

家畜与野生动物共居的哥伦比亚保护区内，通过16S rRNA基因测序和显微镜验证分析牛、马、犬的肠道原虫及微生物组多样性，发现森林覆盖率与寄生虫多样性正相关，而植被破碎化程度负相关。研究揭示景观格局对寄生虫分布的双重影响，警示保护区内人兽交叉传播的生态风险。

　　

摘要

目的

畜牧业的可持续性涉及环境、经济和社会多个方面，尤其是其对动物健康的影响。本研究旨在评估哥伦比亚保护区内生产系统中家养动物的真核胃肠道寄生虫和微生物群的多样性。在这些保护区内，家畜与野生哺乳动物（如灵长类动物、美洲狮、安第斯熊和貘）共同生活。具体而言，我们研究了自然植被破碎化与寄生虫多样性、丰富度和均衡性之间的关系。

方法

通过Nanopore测序技术对牛、马和家犬的粪便样本中的18S rRNA基因进行宏条形码分析，重点关注原生动物作为关键指标。显微镜检查用于验证分子结果。我们计算了流行病学参数（包括感染率、平均感染强度和平均丰度），并应用贝叶斯泊松回归模型来评估景观特征与寄生虫或真菌多样性之间的关联。

结果

在收集的50个样本中，有27个样本获得了可用的序列，分别检测到牛、马和狗中存在11种、12种和3种寄生虫。牛和马中的真核微生物群及寄生虫多样性与天然森林覆盖率呈正相关，而与森林形状的不规则性呈负相关，这表明更大、更连片的森林有利于更高的寄生虫多样性。

结论

在保护区内，家畜与野生哺乳动物之间的寄生虫传播存在双向生态风险。虽然广阔的森林覆盖率有助于增强生态系统的完整性，但也可能增加寄生虫的多样性，从而对家畜健康和疾病管理策略产生影响。