新发现！菜豆叶皱病毒（CleLCrV）从杂草 “跳跃” 至番茄的基因组特征研究

巴西研究人员对菜豆叶皱病毒（CleLCrV）进行研究，发现其从杂草到番茄的宿主跳跃事件，为相关研究提供依据。

　　本文报道了一种新型菜豆叶皱病毒（CleLCrV，即Begomovirus cleomecrispi）分离株的完整基因组特征，该病毒经历了罕见的从十字花科杂草到番茄的宿主跳跃事件。该分离株最初在巴西番茄样本的高通量测序（HTS）分析中被检测到，具有典型的双分体结构，DNA-A 组分包含 6 个开放阅读框（ORF），其中包括 AC5，DNA-B 组分包含 2 个 ORF。对这两个组分进行桑格测序，证实了 HTS 的结果。重组分析表明，DNA-A 组分存在假定的重组信号，涉及单分体番茄斑驳曲叶病毒的 AV1/AC5 开放阅读框。对整个 DNA-A 组分进行系统发育分析，将该新型分离株与来自原始杂草宿主（Cleome affinis）的 CleLCrV 分离株聚为一类。然而，在该分离株的迭代子和结构螺旋 4 基序中检测到特定的基因组差异。本研究支持了之前的观察结果，即双生病毒从杂草到番茄的宿主跳跃事件在新热带地区自然发生。值得注意的是，在 107 个样本中只有 1 个样本的 CleLCrV 检测呈阳性，这意味着由于 HTS 强大的分析能力，检测这些事件是可行的。