基于MATQ-seq技术的细菌单细胞转录组测序新方法

《Nature Protocols》：Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq

编辑推荐：来自国际团队的研究人员针对细菌群体异质性解析难题，开发出革命性的MATQ-seq单细胞转录组测序方案。该方法整合流式分选(FACS)、随机引物反转录和rRNA去除技术，实现95%的细胞保留率及单细胞300-600基因检出量，为微生物组研究提供超灵敏工具。

细菌单细胞转录组学正在颠覆我们对微生物群体异质性的认知。研究者巧妙改造真核生物多聚腺苷酸化依赖的MATQ-seq技术，开发出适用于原核生物的高效单细胞RNA测序(scRNA-seq)方案。该技术路线包含五大关键步骤：①荧光激活细胞分选(FACS)实现单细菌精准捕获与裂解；②全自动液体工作站完成反转录及cDNA扩增；③核糖体RNA(rRNA)特异性去除；④文库构建与高通量测序；⑤生物信息学分析流程。以鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica)为模型验证时，该方法展现出惊人的95%细胞转化效率，远超现有方案。单细胞水平可稳定检测300-600个基因，完美呈现细菌转录组全景。从样本制备到原始数据产出仅需5天，其卓越的兼容性为构建标准化微生物单细胞研究平台奠定基础。