《BMC Medical Genomics》：Liver cancer-specific prognostic model developed using endoplasmic reticulum stress-related LncRNAs and LINC01011 as a potential therapeutic target
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肝癌严重威胁全球健康，为探究内质网应激（ERS）相关长链非编码 RNA（lncRNA）对肝癌预后的影响，研究人员利用 TCGA 数据构建预后模型。结果显示高风险组预后差，且发现 LINC01011 可抑制肝癌细胞增殖、迁移等。该研究为肝癌治疗提供新方向。
肝癌，这个隐匿在人体内部的 “杀手”，悄无声息地威胁着人们的健康。在全球范围内，它是常见的恶性肿瘤，在癌症相关死亡原因中排名靠前。尽管医学在不断进步，但肝癌的发病机制仍迷雾重重，患者的预后情况不容乐观。这就像在黑暗中摸索，迫切需要一盏明灯来指引方向，而这项发表在《BMC Medical Genomics》上的研究，或许就是那盏希望之灯。
安徽医科大学第一附属医院等机构的研究人员，为了揭开内质网应激（ERS）相关长链非编码 RNA（lncRNA）对肝癌预后影响的神秘面纱，展开了深入研究。他们发现，通过特定分析构建的预后模型能有效区分肝癌患者的风险程度，高风险组患者预后较差。同时，LINC01011 作为一个关键的 lncRNA，对肝癌细胞的增殖、迁移等有着重要影响，有望成为潜在的治疗靶点。这一研究成果，为肝癌的治疗和预后评估提供了新的思路和方向，就如同在黑暗中为肝癌研究开辟出了一条崭新的道路。
在研究过程中，研究人员主要运用了以下关键技术方法：从癌症基因组图谱（TCGA）获取临床样本、RNA 数据和突变数据；借助 R 平台的相关工具进行共表达分析筛选 ERS 相关 lncRNA；利用 Cox 回归分析和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）回归等构建并验证预后模型；开展细胞实验，如细胞转染、CCK - 8 实验等来探究关键 lncRNA 的功能。
研究结果如下：
- ERS 相关 lncRNA 筛选及预后模型构建：从分子特征数据库（MSigDB）筛选出 295 个 ERS 相关基因，经共表达分析和差异筛选，确定 355 个差异表达的 ERS 相关 lncRNA（DElncRNAs）。通过一系列回归分析，最终选定 3 个 lncRNA 构建预后模型，即风险评分 = AC026356.1 表达水平 ×0.5223 + AC026412.3 表达水平 ×0.7261 + LINC01011 表达水平 ×0.6208，并根据中位风险评分划分高低风险组。
- 预后模型性能评估：生存分析表明高风险肝癌患者预后差。ROC 曲线显示模型预测准确性良好，1、3、5 年的曲线下面积（AUC）分别为 0.716、0.638 和 0.652。构建的列线图可预测患者 1、3、5 年生存概率，Cox 回归分析证实风险评分的独立预后价值，且在训练集和测试集均验证了模型有效性。
- 富集分析：对高低风险组差异表达基因（DEGs）进行 GO、KEGG 和基因集富集分析（GSEA）。GO 分析发现与细胞激活和白细胞激活的正调控相关功能富集；KEGG 分析显示细胞因子 - 细胞因子受体相互作用、PI3K - Akt 信号通路显著富集；GSEA 分析表明高风险组中细胞外基质（ECM）受体相互作用和细胞因子 - 细胞因子受体相互作用通路显著富集，这些基因与癌症相关生物学过程密切相关。
- 肿瘤突变数据分析：注释和可视化突变数据后发现，高低风险组均存在显著突变。分析发现肿瘤突变负担（TMB）越高，患者生存率越低，且高突变水平和高风险评分的患者生存结局最差。
- 药物敏感性差异分析：利用 “oncoPredict” 工具分析发现，高风险患者对 5 - 氟尿嘧啶等药物更敏感，低风险患者对 AT13148 等药物更敏感，这为个性化治疗提供了参考。
- 肿瘤微环境（TME）及免疫浸润分析：高风险组的 ESTIMATE、免疫和基质评分更高，意味着肿瘤纯度降低。免疫浸润分析显示高风险患者多种免疫细胞浸润更多，免疫检查点分子表达更高，提示免疫治疗在高风险患者中可能更有效。此外，根据风险特征聚类分析将患者分为两个簇，簇 1 患者预后更差，且其 TME 评分更高。
- LINC01011 功能研究：选择 LINC01011 进行深入研究，发现其在肝癌中高表达。沉默 LINC01011 可抑制肝癌细胞增殖、迁移和侵袭，促进细胞凋亡，同时抑制上皮 - 间质转化（EMT）。
研究结论和讨论部分指出，本研究构建的预后模型性能良好，为肝癌预后评估提供了有力工具。TMB 与患者预后的关系、TME 和免疫浸润分析结果，为肝癌治疗策略制定提供了重要依据。药物敏感性差异分析虽有助于个性化治疗，但临床中需综合考虑多种因素。LINC01011 作为潜在治疗靶点极具研究价值，沉默它可抑制肝癌细胞恶性行为。不过，本研究存在一定局限性，如依赖 TCGA 数据库数据，缺乏临床样本验证，LINC01011 沉默后生物学变化机制尚不明确。尽管如此，这项研究依然为肝癌的研究和治疗打开了新的大门，未来的研究可在此基础上进一步探索，为攻克肝癌这一难题带来更多希望。
