乳腺癌寡复发性肺转移的空间多组学剖析：解锁肿瘤微环境新密码，助力精准治疗

《Oncogene》：Spatial multi-omics profiling of breast cancer oligo-recurrent lung metastasis

为解决乳腺癌（BC）肿瘤微环境（TME）异质性带来的治疗难题，研究人员开展基于 BC 及配对肺转移福尔马林固定石蜡包埋样本的研究。结果揭示了 TME 空间差异等，该研究有助于开发新的治疗方案。

　　原发性乳腺癌（BC）和转移性肿瘤展现出不同的肿瘤微环境（TME）生态系统，BC 的 TME 异质性给有效治疗带来了挑战。在单细胞和空间层面评估 TME 为更精准的治疗提供了可能。然而，由于难以同时获取原发性 BC 和寡复发性肺转移的手术标本用于高分辨率空间分析，基于配对样本的肺特异性转移的 TME 在很大程度上仍未被探索。在这项研究中，研究人员开发了一种综合策略，利用成像质谱细胞术（IMC）、空间蛋白质组学、单核 RNA 测序（snRNA-seq）和多重免疫荧光技术，基于 BC 和配对肺转移的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本，探索肺特异性转移的空间拓扑结构和潜在生物学机制。IMC 揭示的总共 250,600 个具有空间信息的高质量细胞描绘了 BC 和肺转移之间 TME 的空间差异。与原发性部位相比，在肺转移中检测到 HLA-DR⁺上皮细胞、内皮细胞和耗竭 T 细胞显著增加，这种差异在三阴性亚型中更为突出。此外，由内皮细胞和 HLA-DR⁺上皮细胞组成的独特细胞枢纽，意味着抗血管生成治疗和免疫治疗在伴有肺转移的 BC 中可能有良好效果，多重免疫荧光分析进一步证实了这一点。空间蛋白质组学进一步探索了 IMC 分析所识别的 TME 成分的潜在机制。snRNA-seq 在整个 FFPE 切片水平上验证了肺转移中内皮细胞比 BC 中更丰富。总之，这项研究利用原发性 BC 和肺寡转移的配对样本，在单细胞分辨率下确定了 TME 成分的空间多组学特征。综合分析可能有助于治疗方案的开发。