CAP/ACMG CYCGH能力验证项目十年回顾：基因组拷贝数变异检测的标准化进程与挑战

美国病理学家学会（CAP）与医学遗传学学院（ACMG）联合开展的CYCGH能力验证（PT）项目，通过22次跨平台检测评估，系统分析了2011-2021年间全球实验室对拷贝数变异（CNV）的检测能力。研究发现参与实验室保持93%的高准确率，同时揭示了平台兼容性挑战，为开发不依赖技术平台的CNV标准化检测方案奠定基础。

　　

在基因组医学时代，染色体微阵列分析（CMA）已成为诊断发育异常和智力障碍的金标准，但不同实验室对拷贝数变异（CNV）的检测能力参差不齐。美国病理学家学会（CAP）与医学遗传学学院（ACMG）意识到，亟需建立统一的质量评估体系来保障临床检测的可靠性。这项发表在《Genetics in Medicine》的研究，通过长达十年的能力验证数据，揭示了基因组检测标准化进程中的关键突破与现存挑战。

研究团队采用双盲法分析22次PT调查（每年A/B两次邮寄），包含44个湿实验样本（DNA标本）和配套干实验（纸质挑战题）。通过统计全球实验室对靶向CNV的检出率，结合平台特异性数据（如Agilent CMA平台），评估了技术演进对检测一致性的影响。

【结果】
• 参与规模：国际实验室参与度持续增长，反映CNV检测需求的全球化趋势
• 检测效能：93%的挑战达成共识，但7%未达标案例暴露平台间差异（如低密度探针阵列的局限性）
• 技术演进：两次重大程序调整对应CMA技术迭代，提示PT设计需动态适应新技术
• 扩展应用：无评级挑战成功评估了罕见CNV和新兴基因组主题的检测能力

【结论与讨论】
该研究证实，将分析性能与临床解释整合为单一检测指标（analyte）的PT方案具有独特挑战性。随着光学基因组图谱等新技术的涌现，研究者正探索开发不依赖特定平台的CNV评估体系。值得注意的是，专业指南的持续更新（如ACMG关于体细胞CNV的解读标准^7-16）与PT项目形成良性互动，共同推动着基因组医学的质量革命。这项工作为国际实验室认证（如CLIA¹⁹⁸⁸）提供了关键数据支撑，其建立的动态评估框架将成为未来复杂基因组检测标准化的范本。