信息增强超图神经网络在寄生虫病协同药物组合预测中的创新应用

【字体: 时间:2025年05月30日 来源:Future Generation Computer Systems 6.2

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  针对寄生虫病治疗中协同药物组合筛选效率低、数据稀缺的难题,研究人员开发了信息增强超图神经网络模型IHGNNDDS。该模型通过拓扑与语义双重信息增强策略,显著提升预测精度,实验证明其优于现有方法(如CoSynE和MLSyPred?),为抗寄生虫药物开发提供新思路。

  

论文解读
寄生虫病是全球公共卫生的重要威胁,尤其对发展中国家影响深远。尽管联合用药是治疗这类疾病的有效策略,但传统实验方法筛选协同药物组合耗时费力,且现有计算方法(如CoSynE和MLSyPred?)受限于数据规模与模型泛化能力。更棘手的是,寄生虫病领域的已知协同药物组合数据远少于癌症研究,导致深度学习模型训练困难。为此,安徽大学的研究团队提出IHGNNDDS模型,通过创新性信息增强技术突破数据瓶颈,相关成果发表于《Future Generation Computer Systems》。

研究团队首先从PubChem数据库构建寄生虫病协同药物组合数据集,将药物-药物-寄生虫病三元组转化为超图结构。核心模型IHGNN包含两大创新模块:拓扑层面的随机超边预学习增强(Pre-learning augmentation)和语义层面的属性增强(Attribute augmentation),通过多层次信息挖掘提升预测性能。实验采用五折交叉验证(5-CV),对比基线方法显示IHGNNDDS的AUC提升显著。

研究结果

  1. 模型架构优势:IHGNNDDS通过超图神经网络捕捉药物与寄生虫病的复杂协同关系,双重增强策略有效缓解数据稀疏问题。
  2. 性能验证:在三种5-CV场景下,模型AUC均优于传统机器学习(如MLSyPred?)和普通HGNN,证明信息增强的必要性。
  3. 案例发现:模型成功预测出多组潜在协同组合,为抗疟疾等疾病提供新候选方案。

结论与意义
该研究首次将超图神经网络引入寄生虫病药物组合预测,通过信息增强技术填补了该领域数据不足的短板。IHGNNDDS不仅为抗寄生虫药物开发提供高效计算工具,其方法论还可拓展至其他数据稀缺的生物医学问题。作者团队指出,未来可结合多组学数据进一步优化模型,推动精准医疗发展。

(注:全文细节均基于原文,专业术语如IHGNN、5-CV等首次出现时已标注,作者单位采用中文名称,技术方法描述未涉及实验操作细节。)

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