《Cell Reports Medicine》:Senescence and inflammation are unintended adverse consequences of CRISPR-Cas9/AAV6-mediated gene editing in hematopoietic stem cells

【字体: 时间:2025年06月04日 来源:Cell Reports Medicine 11.7

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  本研究揭示了CRISPR-Cas9/AAV6介导的造血干细胞(HSPCs)同源定向修复(HDR)基因编辑会意外触发p53/IL-1/NF-κB通路介导的细胞衰老和炎症反应,导致移植后造血重建功能受损。团队发现临床批准的IL-1受体拮抗剂Anakinra可有效缓解衰老表型,提高多克隆造血重建能力,为基因治疗安全性提供了新策略。

CRISPR-Cas9/AAV6基因编辑触发造血干细胞的衰老风暴

在基因治疗领域,造血干细胞(HSPCs)的同源定向修复(HDR)基因编辑一直面临重大挑战。最新研究发现,CRISPR-Cas9/AAV6介导的基因编辑会意外激活两条关键通路:p53介导的DNA损伤反应(DDR)和IL-1/NF-κB驱动的炎症反应,共同导致造血干细胞进入衰老状态。

高精度编辑工具的"副作用"

研究团队采用高特异性gRNA(HS)靶向AAVS1和IL2RG基因位点,配合AAV6载体递送GFP或ΔLNGFR报告基因。令人惊讶的是,HDR编辑的造血干细胞表现出最显著的衰老标志物积累,包括SA-β-Gal活性升高和p16INK4a表达增加。单细胞RNA测序显示,这些细胞中与衰老相关的分泌表型(SASP)相关基因如IL-1α、IL-6和IL-8显著上调。

分子侦探:追踪衰老信号的起源

深入机制研究发现,AAV6载体本身就能激活p53反应,与CRISPR诱导的DNA双链断裂(DSBs)产生协同效应。通过免疫荧光观察到,编辑后的细胞中53BP1和γH2AX foci持续存在,NF-κB核转位增加。特别值得注意的是,这种衰老特征在原始造血干细胞(CD34+CD133+CD90+)中最为明显,并且能传递给分化后代细胞。

从实验室到动物模型:衰老的持久影响

移植实验证实,接受HDR编辑造血干细胞的NSG小鼠表现出造血重建延迟。早期(6周)检测就发现骨髓中CD34+细胞SA-β-Gal阳性率高达60%,且与移植效率呈负相关。这种影响在二次移植实验中依然存在,证明衰老具有长期记忆效应。

创新性干预:三管齐下的解决方案

研究团队测试了三种干预策略:

  1. 瞬时p53抑制(GSE56 mRNA)

  2. IL-1阻断(Anakinra)

  3. NF-κB抑制(SC514)

其中Anakinra表现出最佳综合效果,不仅能降低衰老标志物,还显著改善了多克隆造血重建。通过独特的条形码追踪技术(BAR-seq),证实Anakinra处理组的HDR编辑克隆在长期重建中贡献更大。

安全性评估:Anakinra的额外优势

全外显子测序(WES)显示,Anakinra处理可降低基因编辑相关的突变负荷,特别是癌症相关基因的变异频率。相比之下,单纯的p53抑制虽然提高编辑效率,但增加了大片段缺失(Large deletions)的风险。

临床转化的启示

这些发现为改善基因治疗提供了重要指导:

  1. 优化AAV6载体设计和给药方案

  2. 开发针对DNA损伤和炎症的联合干预

  3. 将Anakinra等已批准药物纳入基因治疗流程

该研究不仅揭示了基因编辑中未被重视的衰老问题,更为提高基因治疗安全性和有效性开辟了新途径。特别值得注意的是,这些发现在脐带血和动员外周血来源的造血干细胞中具有一致性,增强了临床转化的可行性。

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