从陆地泥火山分离的新型无细胞壁厌氧菌Liberiplasma polymorphum的发现及其在Mollicutes类群中的系统分类学意义

【字体: 时间:2025年06月18日 来源:Systematic and Applied Microbiology 3.3

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  俄罗斯研究团队从Taman半岛泥火山分离出新型无细胞壁厌氧菌C05PYGT ,通过多组学分析提出Liberiplasmatales新目,填补了Mollicutes类群中自由生活菌株的认知空白,为微生物进化与极端环境适应机制研究提供关键案例。

  

在微生物世界的隐秘角落,有一类被称为"软皮动物"的奇特生命——Mollicutes(柔膜菌纲)。这些缺乏细胞壁的微小生物,绝大多数过着寄人篱下的生活,依赖动植物宿主提供营养。然而近年来,科学家在深海冷泉、高盐卤水等极端环境中,陆续发现了少数"自力更生"的自由生活种类,它们如同微生物界的"鲁滨逊",挑战着人们对这类生物生存极限的认知。

俄罗斯科学院的研究团队将目光投向了Taman半岛的泥火山。这些地质活动剧烈的区域,持续释放着甲烷和深层沉积物中的有机物质,孕育着独特的微生物群落。2022年5月,研究人员从Gnilaya Gora火山口的淤泥中,分离出一株代号C05PYGT
的神秘菌株。

这株直径仅0.40–0.46 μm的微小生物,在显微镜下展现出多变形态——多数呈非运动性球菌,部分呈现不规则杆状。更令人惊奇的是,它能穿透0.45 μm的滤膜,在5–37°C的温度范围和pH 7.5–10.0的碱性环境中生长,最佳条件为30°C、pH 8.0–9.0。基因组测序显示其2.0 Mb的DNA中,G+C含量低至33.0%,典型的重度基因组缩减特征。

研究人员采用多学科技术手段展开研究:通过透射电镜确认无细胞壁结构,化学分析揭示其C16:0
和i-C17:0
为主的脂肪酸特征,基因组测序结合120个标记基因构建系统发育树。结果显示该菌株代表着一个全新的进化分支,与已知的Acholeplasmatales(无胆甾原体目)亲缘最近,但16S rRNA相似度不足86%。

表型特征揭示其独特的代谢能力:作为化学有机异养菌(chemoorganoheterotroph),它能发酵单糖、多糖甚至蛋白质,但必须依赖酵母提取物生长。尤为特殊的是,该菌展现出降解外源DNA的能力,暗示其在自然环境中的特殊生存策略。基于这些发现,研究者提出了全新的分类单元——Liberiplasma polymorphum gen. nov., sp. nov.(多形自由原体),并建立了Liberiplasmataceae(自由原体科)和Liberiplasmatales(自由原体目)。

这项发表于《Systematic and Applied Microbiology》的研究,打破了人们对Mollicutes类群生态位的传统认知。该菌株不仅丰富了极端环境微生物资源库,其独特的代谢特征更为理解从寄生到自由生活的进化过渡提供了"活化石"样本。研究同时揭示了泥火山作为微生物多样性热点区域的重要性,为地球深部生物圈研究开辟了新视角。

在讨论部分,作者M.A. Khomyakova等指出,Liberiplasma的发现填补了"Izemoplasmatales"(暂定名)分类单元的空白,其较完整的代谢网络(相比寄生性近缘种)暗示了早期Mollicutes的祖先特征。研究获得俄罗斯科学基金会资助(25–24–00052),菌株保藏于VKM B-3767T
等国际培养中心,为后续比较基因组学和进化研究奠定了物质基础。

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