铁还原菌Escherichia sp. F1基因组解析：揭示Fe(III)还原与有机卤化物降解的双重环境修复潜能

来自中国的研究团队针对环境污染修复需求，完成了铁还原菌Escherichia sp. F1的全基因组测序。该菌株从广东中山市有机卤化物污染土壤中分离，基因组规模4.99 Mb（GC含量50.59%），鉴定出53个Fe(III)还原相关基因及2个(S)-2-卤代酸脱卤酶基因，为重金属和有机污染物协同治理提供新型微生物资源。

　　

科研人员从广东省中山市有机卤化物污染土壤（坐标113°14′38″E, 22°33′37″N）中分离出一株具有双重环境修复潜力的铁还原菌Escherichia sp. F1。通过梅花采样法获取土壤样本后，采用厌氧富集培养技术（含3 g/L柠檬酸铁FeC₆
H₅
O₇
的培养基）成功分离该菌株，其培养液特征性颜色变化（棕黄→无色）直观证实了Fe(III)还原能力。

PacBio SMRT Sequel II平台完成高质量基因组测序（N₅₀
7,951 bp），经Hifiasm组装和Pilon抛光获得4,989,604 bp环形基因组。功能注释揭示该菌株携带53个铁还原相关基因和2个(S)-2-haloacid dehalogenase基因，暗示其可同步转化重金属和降解有机污染物。系统发育分析显示其16S rRNA与Escherichia coli 160-c pink相似度达99.71%，但独特的代谢基因组合使其成为环境生物修复的潜力候选者。

值得注意的是，培养基中添加的二硫苏糖醇（C₄
H₁₀
O₂
S₂
）可能通过调控氧化还原电位促进菌株代谢活性。该研究为开发"一菌多用"的环境修复策略提供了重要遗传资源，后续需通过蛋白质组学和酶活实验验证相关代谢通路功能。