纳米孔测序在细菌性肺炎微生物诊断中的应用：系统综述与荟萃分析

《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》：Nanopore sequencing for microbiological diagnosis of bacterial pneumonia: A systematic review and meta-analysis

【字体：大中小】 时间：2026年01月09日 来源：European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 3

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　　纳米孔测序在细菌性肺炎诊断中的准确性及效率评估：系统综述与Meta分析显示，纳米孔测序（MinION和GridION平台）在细菌性肺炎诊断中敏感性86.08%，特异性84.97%，AUC达0.922，显著优于传统培养和短读mNGS，尤其在VAP诊断中表现更优，但需进一步优化样本类型和平台选择。

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摘要

目的

准确且及时的诊断对于有效管理细菌性肺炎、改善患者预后至关重要。本研究旨在评估将宏基因组纳米孔测序技术用于肺炎微生物诊断的效果，并将其与标准诊断方法进行比较。

方法

我们在多个数据库中进行了全面的文献检索，并使用“诊断准确性质量评估2”（QUADAS-2）工具来评估偏倚风险。同时计算了合并后的灵敏度、特异性、阳性预测值（PPV）、阴性预测值（NPV）、诊断比值比（DOR）以及曲线下面积（AUC）。

结果

共有13项研究被纳入系统评价，其中8项符合进行荟萃分析的条件。在细菌性肺炎的微生物诊断中，使用MinION和GridION两种平台的纳米孔测序技术的总体灵敏度为86.08%（95%置信区间：75.96–92.37），特异性为84.97%（95%置信区间：75.94–91.02）。结果显示，该技术的阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）均较高（分别为85.13%和85.27%），基于计算得出的AUC（0.922）和DOR（40.68；95%置信区间：11.22–147.48），其诊断价值也较高。灵敏度分析表明，使用MinION设备的诊断准确性略高于GridION平台。此外，当诊断重点为呼吸机相关性肺炎（VAP）或仅使用气管吸痰样本时，诊断准确性更高。

结论

与传统培养方法相比，纳米孔测序能够提供更快速、实时的检测结果。其特异性也高于短读长宏基因组下一代测序（mNGS）技术，尤其是在呼吸机相关性肺炎的诊断中。有必要进一步开展亚组分析，以优化纳米孔测序在细菌性肺炎检测中的应用。

目的

准确且及时的诊断对于有效管理细菌性肺炎、改善患者预后至关重要。本研究旨在评估将宏基因组纳米孔测序技术用于肺炎微生物诊断的效果，并将其与标准诊断方法进行比较。

方法

我们在多个数据库中进行了全面的文献检索，并使用“诊断准确性质量评估2”（QUADAS-2）工具来评估偏倚风险。同时计算了合并后的灵敏度、特异性、阳性预测值（PPV）、阴性预测值（NPV）、诊断比值比（DOR）以及曲线下面积（AUC）。

结果

共有13项研究被纳入系统评价，其中8项符合进行荟萃分析的条件。在细菌性肺炎的微生物诊断中，使用MinION和GridION两种平台的纳米孔测序技术的总体灵敏度为86.08%（95%置信区间：75.96–92.37），特异性为84.97%（95%置信区间：75.94–91.02）。结果显示，该技术的阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）均较高（分别为85.13%和85.27%），基于计算得出的AUC（0.922）和DOR（40.68；95%置信区间：11.22–147.48），其诊断价值也较高。灵敏度分析表明，使用MinION设备的诊断准确性略高于GridION平台。此外，当诊断重点为呼吸机相关性肺炎（VAP）或仅使用气管吸痰样本时，诊断准确性更高。