乙型肝炎病毒相关B细胞非霍奇金淋巴瘤的表观遗传与RNA调控机制研究

《Scientific Reports》:Hepatitis virus-associated B cell non-Hodgkin’s lymphoma involves dysregulated epigenetic and RNA-mediated regulatory gene expression and altered snoRNA transcription

【字体: 时间:2026年01月11日 来源:Scientific Reports 3.9

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  本研究针对HBV/HDV感染与B细胞非霍奇金淋巴瘤(BNHL)发生的机制空白,通过RNA测序分析蒙古族患者外周B细胞转录组。研究发现病毒相关和非病毒相关BNHL均存在表观遗传调控基因和miRNA介导的基因沉默通路共同失调,而snoRNA上调可能是病毒特异性促进B细胞转化的新机制。该成果为HBV/HDV相关淋巴瘤的诊疗提供了新靶点。

在全球范围内,慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染影响着约2.54亿人,其中约4.5%合并丁型肝炎病毒(HDV)感染。尽管HBV在肝细胞中的致病机制已有深入研究,但其与B细胞非霍奇金淋巴瘤(BNHL)发生的关联机制仍不明确。临床流行病学数据显示慢性HBV感染显著增加BNHL(尤其是弥漫大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤)风险,且HBV阳性患者预后更差。更令人困惑的是,作为HBV卫星病毒的HDV在BNHL发展中的作用几乎未被探索。病毒是否通过直接感染B细胞或间接免疫调控驱动淋巴瘤发生?这一科学问题的解答对肝炎高发地区(如蒙古)的淋巴瘤防治具有迫切意义。
为揭示这一谜题,美国国立卫生研究院临床中心输血医学科Amanda N. Henning团队与蒙古国立医科大学合作,在《Scientific Reports》发表最新研究。团队选取蒙古地区 endemic(地方性流行)的HBV/HDV感染人群,通过RNA测序技术对比分析了健康供者、单纯HBV感染、HBV/HDV共感染、HBV/HDV相关BNHL及非病毒相关BNHL患者的外周B细胞转录组图谱,试图捕捉慢性感染阶段潜在的促癌化转录特征。
研究采用的关键技术包括:从蒙古第一中央医院招募的26例患者外周血单核细胞(PBMC)中分离B细胞,使用Illumina NextSeq 550平台进行RNA测序;通过DESeq2进行差异表达分析(|log2FC|>1且调整后p<0.05);利用MiXCR工具评估B细胞克隆性;并采用GSEA、IPA等生物信息学工具进行通路富集分析。
转录分析揭示慢性感染B细胞的免疫抑制特征
相较于健康供者,所有疾病组均出现大量上调差异表达基因(432-626个)。GSEA分析显示慢性感染患者B细胞中免疫激活与细胞因子信号通路基因集显著负富集,且上游调控因子预测提示TNF、IL-6、IFNγ等促炎因子被抑制,而MAPK/PI3K通路抑制剂被激活。这表明慢性HBV/HDV感染可能诱导外周B细胞呈现免疫抑制状态,但其在BNHL/HBV/HDV样本中较弱,提示淋巴瘤发生可能伴随免疫抑制状态的解除。
克隆扩增并非HBV/HDV相关BNHL普遍特征
与团队早前在HCV相关淋巴瘤中发现的广泛外周B细胞克隆扩增不同,本研究仅在一例BNHL/HBV/HDV患者中检测到高频克隆(占40.6%,CDR3序列为CQQYYSTPGTF),且未发现B细胞无能相关基因集富集。这表明HBV/HDV相关淋巴瘤的驱动机制可能不同于HCV,直接作用机制或许占主导地位。
表观遗传与RNA调控通路共同失调
185个基因在全部疾病组中共同上调,GO分析显示这些基因显著富集于表观遗传调控(如SWI/SNF、NuRD染色质重塑复合体组分ARID1A/B、GATAD2A;COMPASS组蛋白甲基转移酶复合体成员KMT2A/B/D)和miRNA介导调控通路(如RISC复合体核心蛋白TNRC6A-C、CCR4-NOT去腺苷酸化复合体组分CNOT3)。这些调控因子的集体上调可能通过改变B细胞的表观基因组和转录后调控水平,创造共同的致瘤微环境。
snoRNA上调或为病毒特异性转化机制
研究最显著的发现是慢性感染组(尤其HBV单感染)中69个小核仁RNA(snoRNA)显著上调,其中65个在HBV组中高表达。多数snoRNA位于核糖体蛋白基因内含子区,但其表达与宿主基因无关(仅3个宿主基因差异表达)。相关性分析显示这些snoRNA与核糖体生物合成因子(RBF)、介导复合体基因表达高度正相关。31个差异表达snoRNA在癌症中具已知功能,如SNORD76在肝癌中促癌而在胶质瘤中抑癌;SNORD33/46/76在全部感染组中共同上调。提示病毒可能劫持核糖体生物合成通路,通过snoRNA的非经典功能(如调控mRNA稳定性)驱动B细胞转化。
机制模型:直接与间接作用并存
研究者提出双机制模型:一方面,HBV病毒蛋白HBx和HDAg可能直接干预B细胞的表观遗传调控器(如EP300/CREBBP)和核仁功能(与核仁磷酸蛋白相互作用),改变核糖体生成;另一方面,病毒通过细胞外囊泡递送病毒组分间接影响B细胞功能。值得注意的是,团队在一位HBV单感染患者B细胞中检测到覆盖度完整的HBV转录本,为病毒直接感染淋巴细胞提供了证据。
该研究首次系统揭示了HBV/HDV感染背景下B细胞转化的转录特征,提出表观遗传失调和P-body(处理小体)功能异常可能是淋巴瘤发生的共同通路,而snoRNA介导的核糖体重构则是病毒特异性机制。这些发现不仅为理解肝炎病毒相关淋巴瘤的发病机制开辟新视角,更提示snoRNA和表观遗传调控因子可作为潜在的治疗靶点,对肝炎高发地区的淋巴瘤防治具有重要临床意义。

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