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中国汾河流域淡水沉积物中不动杆菌属新种——汾河不动杆菌(Acinetobacter fenheensis sp. nov.)的鉴定及其基因组特征研究

《Annals of Microbiology》:Acinetobacter fenheensis sp. nov., isolated from freshwater sediment of the Fenhe River Basin, China: polyphasic characterization and genomic analysis

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年10月01日 来源:Annals of Microbiology 5.1

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   摘要背景不动杆菌属(Acinetobacter)的成员广泛分布于水体和沉积物生境中,但淡水沉积物相关谱系的分类多样性和基因组特征仍未得到充分表征。本研究旨在确定从中国汾河流域沉积物中分离的菌株FR7-9?的分类位置,并考察其可能与环境持久性相关的基因组特征。结果菌株FR7-9

  

摘要

背景

不动杆菌属(Acinetobacter)的成员广泛分布于水体和沉积物生境中,但淡水沉积物相关谱系的分类多样性和基因组特征仍未得到充分表征。本研究旨在确定从中国汾河流域沉积物中分离的菌株FR7-9?的分类位置,并考察其可能与环境持久性相关的基因组特征。

结果

菌株FR7-9?为革兰氏染色阴性、兼性厌氧、不可运动、短杆状细菌,在10–40 °C、pH 5.0–9.5和0–8.0% (w/v) 氯化钠(NaCl)条件下可生长。利用单拷贝直系同源蛋白进行的属水平基于基因组的系统发育分析将菌株FR7-9?归入不动杆菌属(Acinetobacter),作为一个独立的谱系,与扎伊柔不动杆菌(Acinetobacter zhairuonensis)、康纳菌(Acinetobacter kanungonis)和西藏不动杆菌(Acinetobacter tibetensis)相关。其草图基因组包含40条contigs,总长3,332,809 bp,DNA G + C含量为42.1%。FR7-9?与所选参考模式菌株之间的平均核苷酸同一性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值分别为75.0–84.0%和20.6–26.7%,均远低于公认的种界限。主要脂肪酸为C16:0、C18:1 ω9c和合并特征3;主要极性脂为磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油和二磷脂酰甘油;呼吸醌为Q-8和Q-9。基因组分析鉴定出与磷酸盐获取和多聚磷酸代谢相关的基因,以及多个假定的抗菌抗性决定子,其中主导为外排相关基因。几个抗性相关位点位于被注释为转座酶、重组、质粒或噬菌体相关基因附近。

结论

表型、化学分类、系统基因组和基因组相关性证据支持将菌株FR7-9?确认为不动杆菌属(Acinetobacter)的一个新种,提议命名为Acinetobacter fenheensis sp. nov.(汾河不动杆菌新种)。模式菌株为FR7-9?(= CICC 25278? = MCCC 1K08999? = KCTC 8398?)。其基因组为深入研究淡水沉积物中不动杆菌的养分获取和抗性相关特征提供了分类和功能基线。

背景

不动杆菌属(Acinetobacter)的成员广泛分布于水体和沉积物生境中,但淡水沉积物相关谱系的分类多样性和基因组特征仍未得到充分表征。本研究旨在确定从中国汾河流域沉积物中分离的菌株FR7-9?的分类位置,并考察其可能与环境持久性相关的基因组特征。

结果

菌株FR7-9?为革兰氏染色阴性、兼性厌氧、不可运动、短杆状细菌,在10–40 °C、pH 5.0–9.5和0–8.0% (w/v) 氯化钠(NaCl)条件下可生长。利用单拷贝直系同源蛋白进行的属水平基于基因组的系统发育分析将菌株FR7-9?归入不动杆菌属(Acinetobacter),作为一个独立的谱系,与扎伊柔不动杆菌(Acinetobacter zhairuonensis)、康纳菌(Acinetobacter kanungonis)和西藏不动杆菌(Acinetobacter tibetensis)相关。其草图基因组包含40条contigs,总长3,332,809 bp,DNA G + C含量为42.1%。FR7-9?与所选参考模式菌株之间的平均核苷酸同一性(ANI)和数字DNA-DNA杂交(dDDH)值分别为75.0–84.0%和20.6–26.7%,均远低于公认的种界限。主要脂肪酸为C16:0、C18:1 ω9c和合并特征3;主要极性脂为磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油和二磷脂酰甘油;呼吸醌为Q-8和Q-9。基因组分析鉴定出与磷酸盐获取和多聚磷酸代谢相关的基因,以及多个假定的抗菌抗性决定子,其中主导为外排相关基因。几个抗性相关位点位于被注释为转座酶、重组、质粒或噬菌体相关基因附近。

结论

表型、化学分类、系统基因组和基因组相关性证据支持将菌株FR7-9?确认为不动杆菌属(Acinetobacter)的一个新种,提议命名为Acinetobacter fenheensis sp. nov.(汾河不动杆菌新种)。模式菌株为FR7-9?(= CICC 25278? = MCCC 1K08999? = KCTC 8398?)。其基因组为深入研究淡水沉积物中不动杆菌的养分获取和抗性相关特征提供了分类和功能基线。

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