基于"全民参与"队列对PTEN错构瘤肿瘤综合征患病率、临床表型及变异谱的人群研究

《Communications Medicine》：Population-based characterization of PTEN hamartoma tumor syndrome

　　

摘要

背景

PTEN 错构瘤肿瘤综合征（PHTS）是由PTEN基因变化引起的遗传性癌症易感性疾病。其真实患病率和完整的临床特征范围尚不明确。本研究旨在确定该疾病的发生频率，并更好地描述其在一般人群中的健康影响。

方法

我们分析了来自"All of Us"研究计划 414,830 名参与者的遗传学和电子健康记录（EHR）数据，以识别致病/可能致病（P/LP）PTEN生殖系变异携带者，并刻画其癌症史、首次诊断年龄、临床表型及变异谱。我们将 P/LP 携带者与意义未明PTEN变异（VUS）携带者进行了比较，并将"All of Us"的PTEN变异谱与克利夫兰诊所临床确定的 PHTS 队列的变异谱进行了比较。

结果

我们确定了 55 名携带 P/LPPTEN变异的个体，其中大多数此前未诊断为 PHTS。该疾病影响约每 7500 人中的 1 人，比先前报道的高 26 倍，并与近期基于人群的估算一致。在 46 名有 EHR 数据的携带者中，20 人（43.5%）至少有 1 次癌症诊断（中位年龄 46 岁）。表型富集显示出了预期的过度生长相关特征以及此前报道不足的相关性，包括腺样体扁桃体肥大、睡眠呼吸暂停、黑棘皮病和极度肥胖。与 P/LP 携带者相比，PTEN VUS 携带者的癌症几率较低（OR，0.31；95% CI 0.16–0.61；P?P?

结论

这些发现表明，PHTS 比当前临床实践所反映的情况更为常见、异质性更强且常未被诊断，这强调了基于人群的基因组学在全面表征和早期检测 PHTS 方面的价值。