乙型肝炎病毒感染期间肝细胞染色质的稳定状态

《Scientific Reports》：Stable state of hepatocyte chromatin during hepatitis B virus infection

　　

摘要

乙型肝炎病毒（HBV）是一种嗜肝DNA病毒，可引发慢性感染，并导致肝病和肝细胞癌。尽管HBV的持续存在依赖于核内共价闭合环状DNA（cccDNA）小染色体的形成，但HBV在宿主染色质中的空间分布及其对宿主转录和表观基因组的影响仍不甚明了。在这项研究中，我们分析了HBV DNA与宿主染色质之间的相互作用、感染对三维基因组结构的影响，以及由此产生的转录和表观基因组反应。通过在HepG2-hNTCP-C4细胞及原代人肝细胞（PHHs）中采用整合的4C-seq、in situ Hi-C、RNA-seq和ChIP-seq/CUT&Tag技术，我们定量绘制了HBV的结合区域，并评估了这些区域的染色质状态及其分布偏好。HBV DNA主要定位于富含基因、具有转录活性的区域，这些区域富含CpG岛、启动子和基因本体，且不会引起A/B染色质区室的全球性重组。宿主的转录活性和组蛋白修饰模式基本保持稳定，仅有细微且局部的变化。相比之下，病毒的小染色体显著富集了H3K4me3和H3K27ac，表明其具有内在的活跃染色质状态。这些发现表明，HBV能够选择性地与具有转录活性的染色质结合，同时维持宿主的核结构，体现了病毒“隐匿”感染与高效转录及持续感染之间的精细平衡。