位于染色体外DNA和均质染色区域中的一个保守增强子位点可激活3组髓母细胞瘤中的MYC基因转录 开放获取

《Cancer Research》：A Conserved Enhancer Locus in Extrachromosomal DNA and Homogeneously Staining Regions Activates MYC Transcription in Group 3 Medulloblastoma Open Access

　　

摘要

MYC在3组髓母细胞瘤（G3-MB）中的染色体外DNA（ecDNA）或均匀染色区域（HSR）上被扩增，这预示着较差的预后。更好地理解MYC在ecDNA和HSR中的表达机制有助于开发针对G3-MB的改进治疗方法。通过结构-功能分析，我们鉴定并表征了一个增强子（ecMYC E1），该增强子能够特异性地在具有MYC扩增的ecDNA或HSR的G3-MB中驱动MYC的激活。ecMYC E1位点仅在具有MYC扩增的G3-MB中表现出增强子特征，而在其他依赖MYC的癌细胞系中则没有这种特征，包括那些也具有MYC扩增的细胞系。沉默ecMYC E1增强子显著降低了MYC的转录，但这种降低被ecDNA拷贝数的增加所抵消。Neuronal differentiation 1和bromodomain-containing protein 4相互作用并结合到ecMYC E1上，将增强子连接到MYC启动子。这些发现共同揭示了一种机制，该机制专门在G3-MB中调节ecDNA或HSR中的MYC基因表达。

意义：

结合结构和功能分析方法，我们鉴定出一个保守的增强子，该增强子仅在具有MYC扩增的ecDNA和HSR阳性的3组髓母细胞瘤中激活MYC的转录，这为抑制MYC提供了一个潜在的治疗靶点。