与高密度培养草鱼生长分化相关的血浆外泌体:miRNA-蛋白质分析揭示的跨组织通信网络
《International Journal of Molecular Sciences》:Plasma Exosomes Associated with Growth Divergence in High-Density Cultured Grass Carp (Ctenopharyngodon idella): miRNA-Protein Profiling Reveals Cross-Tissue Communication Networks
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时间:2026年07月07日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
鲤鱼(Ctenopharyngodon idella)是中国重要的淡水养殖鱼类,但在高密度密集养殖条件下其生长会受到限制。本研究旨在通过分离并分析培养9个月后生长快和生长慢的鲤鱼所释放的外泌体,探讨与不同生长表现相关的血浆外泌体特征。这些外泌体具有典型的形态,并表达特定的标志物(CD63、CD81、TSG101)。小RNA测序共检测到3325种miRNA,其中177种丰度较高的miRNA存在差异表达:生长快的鱼体内与免疫相关的miRNA表达上升,而抑制发育的miRNA表达下降。目标基因富集分析显示了与神经和骨骼发育以及氨基酸代谢相关的通路。跨组织综合分析发现,有26种miRNA在血浆外泌体与大脑、肝脏或肌肉中的表达模式一致,这一结果也通过qPCR得到了验证。DIA蛋白质组学技术检测到了4203种蛋白质,其中843种蛋白质的表达存在差异,这些蛋白质与免疫反应、能量代谢以及内质网应激有关。值得注意的是,TYMP在肌肉和组织外泌体中的表达均上升,而在大型鱼类的多种组织及外泌体中,有一些蛋白质(如GYG2、BHMT)的表达则出现同步下降。这些研究结果为硬骨鱼类中外泌体介导的跨组织通讯提供了全面的证据,同时也表明血浆外泌体中的miRNA和蛋白质可能作为与养殖鱼类生长状况相关的无创生物标志物。
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