栖息在不同海拔高度的雉鸡的比较基因组学与群体基因组学分析

《BMC Genomics》：Comparative and population genomics analyses of eared pheasants inhabiting highly varying altitudes

　　

摘要

背景

地球上的氧气压力会随着海拔高度的变化而发生显著变化；然而，人类和动物几乎能够在所有海拔高度正常生存。

研究结果

为更深入地了解亲缘相近的物种如何适应不同海拔环境的遗传基础，我们对比了生活在高海拔地区的白耳雉（WT，Crossoptilon crossoptilon）与生活在低海拔地区的褐耳雉（BR，C. mantchuricum）的基因组。此外，我们还分析了生活在中等海拔地区的白耳雉、褐耳雉以及蓝耳雉（BL，C. auritum）种群中的基因变异，并在每个物种中发现了数千个选择性清除现象。

结论

有趣的是，白耳雉和褐耳雉基因组中的独特基因及假基因，与各自物种中选择性清除现象相关的基因一样，都集中在与海拔适应相关的四类功能路径上。因此，这些物种似乎是通过在相同性状上通过功能缺失突变产生分歧性选择，同时微调共同路径中的基因，从而适应如此大的海拔差异。