Senecio krascheninnikovii Schischk.（菊科）的完整质体基因组：比较分析与系统发育研究

《Journal of Asia-Pacific Biodiversity》：Complete plastid genome of Senecio krascheninnikovii Schischk. (Asteraceae): comparative analysis and phylogenetic insights

　　

阿坎克沙·苏尼尔·杰斯瓦尼|悉达尔坦·苏尔韦斯瓦兰|马诺吉·马德万安德·莱卡克

印度马哈拉施特拉邦科尔哈普尔，希瓦吉大学植物学系，被子植物分类实验室，邮编416004

摘要

Senecio krascheninnikovii Schischk.（菊科）是一种广泛分布于中亚和南亚高海拔地区的物种，与S. vulgaris L.这一Senecio属的模式种关系密切。尽管该属的物种数量众多（约1200种），但其遗传信息，尤其是质体基因组，至今仍了解甚少。在本研究中，我们对S. krascheninnikovii的完整质体基因组进行了测序和分析，并与其他Senecioneae族成员进行了比较基因组和系统发育分析。该质体基因组长度为151,132 bp，包含132个基因，其中包括87个蛋白质编码基因、37个tRNA基因以及8个rRNA基因。比较分析显示，该基因组的结构具有保守性，单核苷酸重复序列以A/T为主，且密码子多以A/U结尾。研究还发现了若干高度变异的区域，如- UUG、、、-以及，这些区域有可能作为分子标记。基于质体基因组、蛋白质编码基因以及核糖体内部转录间隔区数据的系统发育分析支持Senecio属的单系性，并将S. krascheninnikovii归类为与和亲缘关系较近的物种。