对197例帕金森病患者的全基因组测序在印度人群中发现了新的致病变异

《npj Parkinson's Disease》：Whole-genome sequencing of 197 cases with Parkinson’s disease reveals novel pathogenic variants in the Indian population

摘要

目前关于帕金森病遗传学的研究大多来自欧洲人群，印度人群的基因组多样性尚未得到充分研究。为填补这一空白，我们对197例印度帕金森病患者进行了全基因组测序（其中106例为早发型帕金森病，91例为晚发型帕金森病），检测了单核苷酸变异、插入缺失、剪接变异以及结构变异。我们在7个与帕金森病相关的基因中发现了31例患者的致病变异，这些基因包括GBA1、PRKN、PINK1、DJ1、SYNJ1、SNCA和PLA2G6，其在早发型帕金森病中的诊断率为27.6%，在晚发型帕金森病中为2.2%。其中7种变异在印度人群中是首次被发现。GBA1和PRKN是突变频率最高的基因。含有致病变异的候选基因多与溶酶体代谢途径相关。这些患者的多基因风险评分明显更高，这表明多基因因素也可能参与帕金森病的发病风险。我们的研究为印度帕金森病遗传学研究提供了首批全面的基于测序的数据资源，同时也强调了在不同人群中进行大规模基因组研究的必要性。