卵巢癌候选治疗靶点 NCCRP1 的多组学、药物基因组学及结构表征

《Naunyn-Schmiedeberg's Archives of Pharmacology》：Multiomics, pharmacogenomic, and structural characterization of NCCRP1 as a candidate therapeutic target in ovarian cancer

摘要

卵巢癌的特点是广泛的分子异质性和较差的临床预后，这凸显了识别生物学相关治疗靶点的必要性。NCCRP1 在卵巢癌中仍未被充分表征，其分子和治疗意义在很大程度上尚不清楚。在本研究中，我们应用了一个整合多组学框架，包括转录组谱分析、生存分析、免疫微环境表征、通路和网络分析、药物基因组学评估、结构建模和单细胞 RNA 测序，以调查NCCRP1 在卵巢癌中的作用。对 TCGA-OV 队列的家族范围筛查确定NCCRP1 是唯一与总生存期显著相关的成员。NCCRP1 表达升高在肿瘤组织中富集，并与不良临床预后相关。功能分析表明，NCCRP1 高表达肿瘤表现出上皮 - 间质转化、细胞骨架重塑、黏附信号和缺氧相关通路的激活，表明其参与肿瘤可塑性和进展。基于网络的分析进一步将NCCRP1 定位在与结构重组和侵袭性肿瘤表型相关的调控程序内。单细胞 RNA 测序证实NCCRP1 表达主要定位于恶性上皮细胞群，支持其肿瘤内在作用。药物基因组学分析确定了NCCRP1 相关转录状态与不同药物敏感性模式相关，而结构建模表明存在能够容纳小分子的表面可及空腔。尽管这些发现需要实验验证，但它们提供了支持NCCRP1 潜在可成药性的初步证据。我们的研究结果提供了NCCRP1 的全面分子表征，并支持其作为卵巢癌候选治疗靶点的优先性。本研究展示了整合多组学、药物基因组学、结构和单细胞方法用于癌症治疗靶点发现和优先排序的效用。