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哺乳动物的基因功能预测
生物通报道：据一篇发表在12月6日的Journal of Biology上的文章报道，利用一种高通量RNA表达模式分析方法能够快速、可靠地预测哺乳动物的基因功能。这种方法挑战了传统的认为组织特异性是最好的功能预测者的观点，并且可能使人们对人类和其它哺乳动物基因组了解所需时间缩短数十年。多伦多大学的Tim Hughes和同事利用一种先前只用于简单生物体（如酵母和线虫）的技术对小鼠的基因组进行了研究。在酵母和其它简单有机体中，具有相同功能的基因的表达往往具有同步调节的特征。在这些有机体中，确定已知和未知基因的相关联的表达能够帮助预测一个新基因的功能。一直以来人们认为这种技术无法用在哺乳动物上，同一
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确定血栓症遗传抑制剂的新型突变筛选
生物通报道：最近，研究人员在试验小鼠中使用了一种新型的、激活性的ENU（N-ethyl-N-nitrosourea）突变诱导筛选方法，这种方法有可能成为一种确定血栓症显性抑制剂的很有潜力的遗传筛选方法。利用这种新遗传筛选过程，研究人员希望能够确定有助于一种遗传性疾病(Factor V Leiden)外显的潜在修饰基因。FVL是一种遗传性的血液凝结疾病，在这种疾病中，凝血过程没有限制因素，因此增加了出现异常的病态和威胁生命的血液凝块（血栓）的危险。发生FVL突变的人其在大静脉中形成血液凝块的可能性较大。FVL是一种不完全显性的突变，在FVL携带者中只有10％的人在他们一生中会发生血栓症。来自密歇
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研究发现A型链球菌感染人类机制的线索
生物通报道：最近，研究人员发现了弄清A型链球菌（GAS）感染人类机制的新线索。这种细菌的一个关键特征是能够产生链激酶（SK），这种酶能够活化血液凝块溶解蛋白——纤维蛋白溶酶原。这项研究的结果将会在美国血液学协会第46届年会上公布。研究结果表明GAS能够攻击软组织和内部器官并能通过降解局部的血管凝块从而在血管和周围的组织中传播。GAS是一类导致多种人类感染性疾病的细菌，其成员包括导致常见的喉咙疼痛的链球菌以及致死性的肉腐细菌。由感染人类的GAS产生的链激酶对人类纤维蛋白溶酶原（PLG）有很高的专一性并且对其它哺乳动物基本没有影响。通过构建一种人类化的转基因小鼠（能够表达人类的PLG），研究人员对
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肽疫苗使骨髓性白血病病人发生分子水平的免除
生物通报道：来自德克萨斯州大学M. D. Anderson癌症中心的研究人员首次发现用一种在骨髓性白血病细胞中异常表达的肽进行接种在一些病人中能够产生一种完全的分子生物缓解作用。这种实验性疫苗在60％的测试病人中引起了一种免疫反应。研究人员在美国血液学协会年会上公布了这些结果。试验中，20个发生针对他们癌症的免疫反应的病人中，有14个人的存活时间延长了4年，而13个没有发生这种反应的病人存活时间都比他们短。有三个病人则发生了分子水平的缓解，即这种疾病在分子水平上免除。一些病人不但发生了免疫反应，而且还在分子水平上得到了免除，这样的效果在肽疫苗出现前是从来没有过的。这种疫苗由PR1肽制成，PR1
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斑马鱼研究 肌肉的形成观察
生物通报道：了解肌肉细胞的形成过程对找到肌肉萎缩等疾病的新疗法以及治疗肌肉损伤具有重要意义。但是，尽管研究人员对培养的肌肉细胞进行了长期的研究，他们对发育胚胎中的肌肉细胞形成过程还是知之甚少。现在，研究人员在斑马鱼胚胎的肌肉细胞发育的研究中有了新突破，他们观察到了两种类型的肌肉纤维的形成过程。这项研究的相关文章发表在本月的Developmental Cell上。目前在生命科学研究中，人、小鼠和斑马鱼是三种主要的模式脊椎动物。而斑马鱼则是世界公认的新兴的模式脊椎动物。与小鼠相比，它具有体外受精、胚胎透明、体外发育、胚胎早期发育快和易于大量获得样品等独有的特点并因此越来越受到研究人员的青睐。新研究
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Udx1酶 “毒精子”的阻滞剂
生物通报道： 对精子来说，进入卵子中就代表着惟我独尊：有数百万个精子想进入卵子，但最终只有一个成功。到目前为止，这种将其它精子排挤掉的机制还仍然是个谜。现在，研究人员确定了一种新的酶，这种酶能够强有力地守护卵子大门。研究人员将这些发现刊登在本月的Developmental Celld上。当一个精子进入卵后，这个卵子就会发生一系列化学反应，这些反应会加固卵的外膜以防止其它精子进入。但是，在有些反应步骤中会产生过氧化氢，理论上这种氧化物能够伤害精子和卵。在过去的20年里，研究人员一直尝试弄清这种过氧化氢如何产生以及它为什么不会造成任何伤害等问题。现在，Brown大学的Gary Wessel等人通过
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美科学家初步培育成“人造细胞”
美国科学家日前在实验室里培育出一种类似于细菌的“人造细胞”。这种简单的“细胞”并不是真正的生命体，不能分裂和进化，但能连续数日生成蛋白质。 专家认为，此项研究结果不仅有利于制药研究，也是“人造生命”方面的一项进展。 在生物细胞内部，蛋白质是以氨基酸为原料，在基因指令的控制下生成的。目前，科学家可以从大肠杆菌等细菌中提取到细胞生成蛋白质所需的生物分子混合物。这些混合物可以产生特殊的蛋白质，但是，如果不持续向其供给原材料并清除废物，它们在两个小时内就会停止蛋白质的生成。 据英国《自然》杂志网站６日报道，美国洛克菲勒大学的科学家将能够生产蛋白质的生物分子混合物悬浮在油中
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抗前列腺癌转移药剂PCK3145作用机制的研究进展
生物通报道：最近，Procyon生物医药公司公布了他们对PCK3145作用机制研究的最新结果。研究人员在最近的试验中发现，PCK3145能够干预血管内皮生长因子（VEGF）信号通路，这个路径对血管新生和之后的癌症转移非常关键。PCK3145是一种以天然的PSP94序列为基础合成的含15个氨基酸的肽，而PSP94则是一种在前列腺中天然合成的蛋白质。依据PCK3145在转移性HRPC（hormme-refractory prostate cancer）临床试验Ⅱa阶段的数据表明血清中MMP-9的浓度能够作为其它一些癌症类型的预警标记，这些癌症类型包括乳腺癌、结肠癌、肺癌和卵巢癌。现阶段
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鲤科小鱼研究揭示人类心脏病疑问
生物通报道：一直以来，医生和病人常常对这样一个问题感到困惑：为什么一些降低胆固醇的药物对一些人效果较好而对另一些人的效果则不理想呢？最近的一项对常见的鲤科小鱼的研究则可能给出了答案。这项研究刊登在2004年12月的Nature Gentics上。迈阿密大学的研究人员Douglas Crawford和Jennifer Roach以及北卡罗莱纳州大学的Marjorie Oleksiak研究了一种鱼的遗传组成并且发现它们心脏肌肉加工脂肪和糖过程的差异为解开这个秘密（为什么一些人吃高脂肪食物不会患心脏病，以及一些治疗药物为什么对某些病人特别有效）提供了重要线索。研究发现，一些心脏利用葡萄糖
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新研究发现了“顽固”细胞的不死秘诀
生物通报道：最近，美国东北大学的研究人员Kim Lewis发现了能够阻止抗生素成功摧毁生物膜感染的基因。研究人员发现了一种促使细菌生物膜对抗生素产生抗性的基因。这些结果公布在最近一期的Journal of Bacteriology上。数年来，研究人员一直试图了解一种类型的感染（生物膜）常常会对抗生素产生抗性的原因。生物膜含有感染所需的细胞，但是这些细胞却不能被抗生素破坏。Lewis发现这些顽固细胞含有一种基因——HipA，这种基因编码一种毒素（RelE毒素），而这种毒素能使这些细胞进入“冬眠”状态。因为抗生素只能在这些细胞处于生活状态下才能摧毁它们，因此这些冬眠的细胞能够耐受抗生素
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在原子水平上破译基因组密码
生物通报道：最近北卡罗莱纳州大学的生物学专家的一项发现使人们进一步了解了遗传信息如何解读并用于蛋白质的制造。研究人员给出了具体的证据支持了Francis Crick在1966年提出的“摇摆假说”和Agris在1991年提出的“修饰摇摆假说”。这项研究公布在2004年12月6日的Nature Structural and Molecular Biology上。摇摆假说是Crick在尝试了解细胞解码DNA遗传信息的机制时提出的。DNA构建了细胞中的所有遗传信息，然后又根据这些信息制造出具有一定生物活性的蛋白质。DNA有61个三联体秘密但是却只有20种天然氨基酸。Crick为了弄清这个问
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化学药受困成本生物药风头渐劲
受今年以来能源、原材料价格上涨影响，化学原料药普遍面临成本困境，化学药企举步维艰，与此同时，高附加值、高利润和高回报的生物制药企业却获得发展的良机。从今年前10个月来看，生物制药业绩不俗，已实现销售收入153亿元，比去年同期增长22.83％，利润也增长了近20％。 据一位业内人士介绍，生物工程药物的利润回报率极高。一种新药上市2至3年即可收回所有投资。尤其是拥有新产品、专利产品的企业，还有可能形成技术垄断优势，利润回报可高达10倍以上。所以，在国内一段时间内无法找到彻底解决能源问题的办法前，生物制药行业的前景非常乐观。由于国家目前着手完善疾病预防控制体系，提高对重大疾病和疫情的预警能力和应对能
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研究人员在试管中重构DNA修复途径NHEJ
生物通报道：到目前为止，研究人员已经知道了细胞中的5种DNA修复机制。现在，南加州大学的研究人员领导的一个国际性研究组已经对其中一种修复机制进行了彻底分析并在试管中重现了这个机制。这个研究组首次重组了“非同源末端连接途径”（NHEJ），这个途径是在实验室中实现重组的第三个修复途径。这些结果公布杂2004年12月3日的Molecular Cell。了解DNA的修复过程对弄清癌症发生过程至关重要，因为癌症常常是在DNA没有得到恰当的修复的时候发生。Michael Lieber博士认为重建这种途径的能力具有非常重要的实际应用价值。为了重建NHEJ途径，研究组首先必须纯化所有在这个途径中需
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研究发现养精蓄锐让你活的更长！
生物通报道：在过去的10年里，有研究表明限制能量使用（如节食）能够延长不同有机体的寿命。现在，来自Elixir Pharmaceuticals的研究人员给出了支持这个理论的一种分子传感器。这个研究组由Javier Apfeld领导，他们发现细胞中AMP和ATP量的增加与线虫寿命的增加存在一定的联系。通常，ATP是身体中的能源物质并且最终能够形成AMP。Apfeld研究组集中研究了一种叫做AMP-1的酶，这种酶只能被高水平的AMP活化并引起一个储存能量的级联反应。利用一系列遗传和分子技术，研究组证明携带多余的AMP-1酶拷贝的线虫比对照平均寿命长13％。其他一些实验证明能够活化AMP
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研究表明病毒具有同一个祖先
生物通报道：Wistar研究所的科研人员与赫尔辛基大学的研究人员发现感染三个生命群体的寄主的病毒在结构上存在相似性。这种结构上的相似性表明尽管这些病毒基因组不同并且其寄主也不同，但是这些病毒却可能由数十亿年前的一个共同的祖先进化而来。这些发现刊登在2004年12月3日Molecular Cell上。到目前为止，研究人员往往将病毒世界看成是由一些不相关的病毒家族组成，很少有人去留意他们的相似性。直到数年前有人发现这些看似无关的病毒之间存在很大的结构相似性，这个方面的研究才逐渐热闹起来。新的研究是以最早的Burnett等人的研究为基础的。他们发现人类腺病毒间存在显著的结构相似性。利用先
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古老哺乳动物的基因组重建
生物通报道：在电影《侏罗纪公园》中，科学家克隆出了各种各样的恐龙。现在，一个研究组已经重建了一种古老动物的基因组，这种生物被认为是所有胎盘哺乳动物的共同祖先。这项研究可能会帮助研究人员解释出哺乳动物DNA的变化如何为人类进化铺平道路的问题。相关文章发表在2004年12月的Genome Research上。要想追溯人类的进化史，首先需要了解我们的直接祖先的一些遗传信息。到现在为止，获得这种信息最大的希望就是恢复妥善保存的化石的DNA。但由于化石中的DNA通常已经退化而无法进行研究，因此古老基因组的重建只能成为科幻小说的宠儿。为了解决这个问题，加州大学的David Haussler等人
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特殊基因有望揭示古人驯化玉米的选种过程
美国科学家在２日出版的《自然》杂志上报告说，他们发现了能控制玉米植株分枝的特殊基因，该基因有望揭示古人在驯化玉米的过程中是如何选种的。 从进化的过程看，美洲印第安人７千年前首先将墨西哥类蜀黍驯化为现代玉米。上世纪２０年代，科学家在南美洲发现了一种植株不分枝也不开花的玉米变异品种。美国加利福尼亚大学的科学家最近对这种玉米进行了研究，结果发现导致玉米出现这种异常现象的原因是，一个名为“秃茎１”的基因出现了变异。正常玉米中的“秃茎１”基因控制着作物的分枝，而该基因在玉米基因图谱中的位置正好处在一个特殊的遗传区域，该区域对玉米被驯化起着关键作用。 在更深入的研究中，科学家将墨西哥现存的野生类蜀黍与现代
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蛋白质组学用于肠道病原物诊断标记确定
生物通报道：最近，新加坡的一项研究表明出血性大肠杆菌（EHEC）和致病性大肠杆菌(EPEC)是两种亲缘关系相近的人类病原物，这些病菌在许多国家引起了食介流行疾病。研究中，科研人员联合使用了一种蛋白质组分析方法——二维聚丙烯酰胺凝胶电泳和基体辅助激光解吸电离飞行时间质谱来分析EHEC EDL933、EPEC E2348/69菌株和他们的IHF、Ler突变体的细胞外蛋白特性。 在EHEC和EPEC中，整合作用宿主因子（IHF）和毒力岛编码调节因子（Ler）是细菌表达毒性基因所必须的。研究人员利用蛋白质组分析方法确定了细胞外蛋白质组中的59个主要蛋白质点，其中包括6种功能未知的蛋白质。他们
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炭疽菌荚膜接种能够预防动物的炭疽菌感染
生物通报道：炭疽菌荚膜是这种致病菌的一个天然成分。最近，美国的研究人员证明用炭疽菌荚膜接种能够预防小鼠发生炭疽菌感染。此外，这种荚膜还能够增加保护性抗原（PA）的效果。PA是目前得到许可的人类疫苗的一种保护性成分。这项研究公布在最近一期的VACCINE期刊上。炭疽菌能够产生三种主要的毒害物质，致死毒素、水肿毒素和荚膜。在感染过程中，细菌能侵入寄主并大量扩增。荚膜围绕在细菌的周围能够防止细菌被寄主的白细胞消化或遭到其它的破坏，因而炭疽菌才能继续在寄主体内发展下去。这种毒素被认为能破坏噬菌细胞并造成免疫系统的功能障碍。目前注册的炭疽疫苗（AVA）的主要作用成分被认为是PA。尽管这种疫苗
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免疫系统基因表现出的种族差异
生物通报道：匹兹堡大学的一项研究表明，一些调节发炎反应的蛋白的编码基因的特定变异体可能是解释在非洲裔美国人中的一些疾病过程的一把金钥匙。研究发现非洲裔美国人和白种美国人的细胞激素基因的等位基因存在显著差异。这些发现公布在2004年12月1日的American Journal of Epidemiology上。研究人员发现非洲裔美国人更容易携带一些能够刺激发炎反应的遗传变异体。同时，能够抑制抗炎性蛋白释放的基因型在非洲裔美国人中更常见。炎症被认为是导致心脏病发作、中风、糖尿病和肾脏疾病的一个重要原因，这些疾病类型在非洲裔美国人中的发病率比白人高。另外一些与发炎反应有关的疾病（包括早产
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