亚硫酸氢盐测序，无法区分5-mC和5-hmC。美国芝加哥大学利用第三代单分子SMRT测序技术和5-hmC的选择性化学标记方法来高通量检测5-hmC。通过聚合酶动力学带来的宝贵信息，研究人员可直接检测DNA甲基化，包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。详情
病原微生物鉴定
由于PacBio从样本制备到获得序列信息所需时间非常短（<1天），在具有时效性的病原微生物鉴定中（例如生物反恐、流行病爆发监控等）也非常有优势。一个国际小组利用Pacific Biosciences的单分子测序技术，深入研究了欧洲大肠杆菌菌株的致病性和进化起源，该研究成果发表在《新英格兰医学杂志》上。详情 |
| “SMRT技术的突出特点是我们不仅能够了解DNA如何合成，还能通过它产生的数据定量分析基因调控、RNA功能、表观遗传调控、DNA修饰和基因组结构。” |
Nikolaus Rajewsky教授
柏林Max Delbruck分子医学中心
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一般CGG重复在200次以上，被认为是具有临床意义的，但这个长度不管对于Sanger法测序或者新一代测序来说，都是很困难的，而PacBio则很好的解决了这个问题。详情
稀有突变检测
二代测序检测的是经过 PCR 扩增后的大量分子的总信号，一方面 PCR 扩增过程中的错配等，会变成系统误差影响最终的测序结果。另一方面，稀有变异在扩增过程中，很容易被淹没在群体中而无法被检出。 PacBio无需扩增、对每一个单分子模板都进行评估，对于混合群体中低至 1/100的稀有突变都可以检出。详情 |
众所周知，天然的DNA复制本身就是一个非常高效且准确的过程。真核生物DNA复制的速度达几十个核苷酸/秒。若能以这样的神速测序，那可比Sanger测序快了几万倍。然而，知易行难。如何在不影响聚合酶活性的前提下实时观察DNA合成，这可是个棘手的问题。要知道，DNA聚合酶的直径只有15 nm。而且，这是一个涉及酶学、表面化学和检测光学的多学科难题。让我们来看看Pacific Biosciences的创始人如何克服三大挑战，开发出PacBio RS。