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IBM超级计算机将用于人类基因组问题的解决
【字体: 大 中 小 】 时间:2000年12月20日 来源:
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世界上最快的商业超级计算机不久将专门用于解决世界上最大的难题。IBM的一台新的超级计算机将用于解决最近在人类基因组解码过程中产生的大量问题。
科学界的一大奇迹,解码人类密码DNA仅仅是第一步。人类基因组计划已经制造出了也许是最强大的和最充满诱惑的数据库——人类基因组图谱。但是分析这些数据是一个巨大的数学难题,而这才是真正揭示我们DNA中潜藏的秘密的过程。
比如,癌症之类的疾病往往不是仅仅由一个缺陷基因导致的,而是由不同基因缺陷共同造成的。目前已经鉴定了35000个基因,揭示那些基因的结合造成某种疾病将是一个繁重的工作。
繁重程度如何呢?据NuTec Sciences, Inc.的发言人Michael Mott说,一台传统计算机将花费447年的时间来解开目前创立的第一个等式。对于等待解码DNA为人类健康带来的奇迹的人而言,这将是太长的一段时间了。
NuTec Sciences, Inc.公司专门开发加速人类基因组计划有关的计算法则。有NuTec设计的软件可以帮助科学家们更快地询问基因组数据——将等待的时间从447年缩短到一个月。
今天,NuTec公司将宣布购买IBM公司的一台新的超级计算机,这台计算机将是世界上第二快的计算机。该系统巨大的计算能力将帮助制药业和生物技术研究人员进行复杂疾病之后潜在的基因之间的各种结合的研究。
NuTec Sciences公司的生命科学部的主席Peter Morrissey说:“筛选堆积如山的基因数据,以找出一个可能是某种特殊疾病的致病因素的四个或五个基因的结合形式,犹如大海捞针。这个功能强大的工具将帮助研究者发现基因之间的关键的关系。我们需要一个超级强大功能的计算环境。”
这台新的计算机将可以每秒钟进行7.5万亿次计算。这比1997年战胜国际象棋冠军Gary Kasparov的那台IBM计算机的速度快600倍。确切地说,这台机器应该是一组计算机,由1250台由2.5千兆内存,50千兆联机磁盘存储器,以及宽带网络基础结构支持的IBM服务器组成。
世界上唯一一台更快的计算机是政府拥有的,放置在Lawrence Livermore实验室的ASCI White。
对于研究公司而言,这台机器将是一个巨大的推动力量,因为在询问基因组数据中包括试验和误差,而每次询问一个月的等待时间对于研究者而言还是相当慢的。
NuTec公司将租借这台计算机给大大小小的,寻求进行各种疾病和原因分析的生物技术和制药公司。
IBM的发言人John Buscemi说:“进行这样的工作,将需要这种超级计算循环。”他说,大部分的公司将可以通过国际互联网使用这台计算机。
——摘译自12月18日