DNA芯片数据不断增加,美将开放新数据库

【字体: 时间:2000年08月03日 来源:

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那些使用点样有基因斑点的玻璃芯片,研究细胞是如何工作的研究者现在有了共享和交流获得的不断增加的成堆数据的地方。上星期,美国国家生物技术信息中心(NCBI)开设了一个新的公众网站数据库,在那里存储了来自DNA微阵列(microarray)和其它热点实验工具的数据,以立即研究成千基因的表达。

这个名为基因表达精选集(Gene Expression Omnibus),或称为GEO的数据库,将免费存储来自包括产品和自制芯片在内的任何类型基因表达检测的数据。科学家可以登录数据库,描述检测类型,上传实验结果——说明基因表达水平的图表——和他们所使用阵列的参考图像。GEO还将存储来自一系列检测(如毒素的剂量反应)的结果。由于目前的首要步骤仅仅是建立数据的储存处,您还不能做许多搜索工作。但是在数月内,“您将可以以不同的方式进行查询,”NCBI的Alex Lash说。他希望GEO和GenBank基因数据库一起,可以平等地收录研究者不准备发表的数据。

目前还至少有两个公众微阵列数据库将开始运作:位于新墨西哥州Santa Fe的国家基因组资源中心(The National Center for Genome Resources)预计今年秋季开放一个数据库,而英国的欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute, EBI)则希望在明年开放另一个数据库。

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